112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1077 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1077  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 
205 aa  407  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0870  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  99.51 
 
 
205 aa  406  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.200456  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1599  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  99.02 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1091  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  85.37 
 
 
205 aa  358  2e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1299  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  55.83 
 
 
206 aa  226  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.64 
 
 
204 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.76 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0089  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.99 
 
 
205 aa  118  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0772  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  37.32 
 
 
198 aa  115  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00698153  hitchhiker  0.000000112154 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4086  phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.288574  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1806  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.71 
 
 
203 aa  112  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2583  phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 
216 aa  108  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2261  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  32.16 
 
 
212 aa  105  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0519341  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0272  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.98 
 
 
204 aa  105  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2276  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.67 
 
 
205 aa  105  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2698  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.18 
 
 
206 aa  104  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2394  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  32.85 
 
 
201 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.421061 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0798  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  33.99 
 
 
211 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0705  phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 
225 aa  102  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0973  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.63 
 
 
202 aa  98.6  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.405367  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1417  phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
194 aa  92  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
193 aa  54.7  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
192 aa  52.4  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0278  orotate phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 
227 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1148  orotate phosphoribosyltransferase  24.19 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4281  orotate phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.326591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1618  orotate phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 
232 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0340  orotate phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0228  orotate phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
236 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  27.19 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001826  orotate phosphoribosyltransferase  27.06 
 
 
213 aa  48.9  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0619  orotate phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
215 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000147946 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0071  orotate phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 
211 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  26.71 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04047  orotate phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 
213 aa  48.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00649  orotate phosphoribosyltransferase  25.88 
 
 
224 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1679  orotate phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0122  orotate phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1381  orotate phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 
192 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000390068  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1196  orotate phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 
192 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100317  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3603  orotate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0353  orotate phosphoribosyltransferase  27.97 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.68295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3776  orotate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
215 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.851332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0289  orotate phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4143  orotate phosphoribosyltransferase  25.73 
 
 
213 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00122436  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0376  bifunctional orotidine 5'-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltransferase protein  28.46 
 
 
500 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0321  orotate phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3478  orotate phosphoribosyltransferase  25.69 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.972793  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1777  orotate phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000386496 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  25.15 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4067  orotate phosphoribosyltransferase  25.73 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00621989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5012  orotate phosphoribosyltransferase  25.73 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.127395  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
212 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 
176 aa  45.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0371  orotate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
213 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2590  orotate phosphoribosyltransferase  26.47 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.431923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4255  orotate phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 
215 aa  45.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0320  orotate phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
213 aa  45.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  25.96 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  25.96 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  25.77 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3835  orotate phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
213 aa  45.1  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03499  orotate phosphoribosyltransferase  25.44 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0295894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0063  orotate phosphoribosyltransferase  25.44 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160441  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2740  orotate phosphoribosyltransferase  25.83 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0457  orotate phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191717  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0370  orotate phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3851  orotate phosphoribosyltransferase  25.44 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4846  orotate phosphoribosyltransferase  28.81 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0116277  decreased coverage  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0382  orotate phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0587643 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0069  orotate phosphoribosyltransferase  25.44 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000170079  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4049  orotate phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000386035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0396  orotate phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  24.79 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03451  hypothetical protein  25.44 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0214857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0225  orotate phosphoribosyltransferase  26.21 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.195509  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3928  orotate phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
223 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  27.56 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  25.41 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0097  orotate phosphoribosyltransferase  25.57 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0812826  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3977  orotate phosphoribosyltransferase  24.85 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  24.59 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_56623  predicted protein  29.41 
 
 
513 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.329951  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2026  orotate phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000542739  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0113  orotate phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
221 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0057  orotate phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0177997  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  24.54 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0051  orotate phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4159  orotate phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
215 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.041732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0041  orotate phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0035  orotate phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3487  orotate phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4059  orotate phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3932  orotate phosphoribosyltransferase  25.93 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0874196  hitchhiker  0.000146436 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  24.8 
 
 
201 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>