More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1639 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  653    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  89.82 
 
 		 334 aa  603  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  86.92 
 
 		 321 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  63.83 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  46.11 
 
 		 336 aa  318  9e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  45.02 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  43.2 
 
 		 336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  42.6 
 
 		 336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  37.07 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  24.58 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  26.87 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  27.64 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  34.3 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  26.42 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  25.66 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  24.22 
 
 		 394 aa  99.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  26.69 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  25.66 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  26.99 
 
 		 360 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  24.26 
 
 		 353 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  25.29 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  25.85 
 
 		 354 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  25 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  26.04 
 
 		 352 aa  92.4  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  28.28 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  22.71 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  23.42 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  25.55 
 
 		 370 aa  89.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  24.68 
 
 		 346 aa  89.7  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  24.92 
 
 		 353 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  26.79 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  25.3 
 
 		 349 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  30.39 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  29.94 
 
 		 354 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  24.79 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  23.81 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  24.79 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  26.33 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  29.7 
 
 		 355 aa  87  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  24.93 
 
 		 398 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  22.58 
 
 		 345 aa  86.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  23.84 
 
 		 372 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  25.5 
 
 		 355 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  29.89 
 
 		 352 aa  85.9  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  25.5 
 
 		 355 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  31.14 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  24.07 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  23.48 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  24.48 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  24.38 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  24.38 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  24.48 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  24.48 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  24.48 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  24.48 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  23.66 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  30.05 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  24.48 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  24.48 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  24.48 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  23.42 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  24.52 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  30.41 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  25.91 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  24.52 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  22.9 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  25.47 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  26.27 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  23.75 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  33.5 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  29.69 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  24.76 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  24.76 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  26.01 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  31.76 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  26.52 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  29.82 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  24.4 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  22.81 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  26.38 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.46 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  31.18 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  21.97 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  25.16 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  26.48 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1111  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  30.41 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  24.58 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  23.68 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  23.92 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  28.93 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2209  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0133966  normal  0.166807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  26.61 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  24.42 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  28.95 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  24.11 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  26.32 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>