More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1433 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0554  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  86.24 
 
 		 381 aa  689    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0486  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  96.84 
 
 		 380 aa  763    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0351  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  95.79 
 
 		 380 aa  734    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1433  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  100 
 
 		 380 aa  781    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.498854  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0681  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  72.75 
 
 		 385 aa  588  1e-167  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0102  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1440  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 387 aa  349  6e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1638  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 386 aa  341  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0796  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 459 aa  289  4e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1614  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 392 aa  276  3e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.193363  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0071  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0929376 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2180  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1163  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 462 aa  256  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.937878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1209  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 459 aa  256  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2045  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 454 aa  256  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1214  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 392 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000547302  normal  0.0195225 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0348  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 392 aa  245  8e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0463622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1050  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0931794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  29.73 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  28.65 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  29.03 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  29.21 
 
 		 380 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  28.1 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  30.56 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  37.23 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  29.44 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  24.49 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  26.75 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.7 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  26.55 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  27.95 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  26.59 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  27.06 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.43 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  38.46 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  38.46 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  25.74 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  27.04 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  27.03 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.81 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  37.04 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  28.86 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  32.63 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  40 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  40 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  40 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  38.57 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  38.57 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  38.57 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  23.2 
 
 		 476 aa  56.2  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  38.57 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  38.57 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  38.57 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  38.57 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  39.19 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  26.39 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  27.91 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  34.41 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  37.14 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  29.05 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  36.62 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  29.09 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  26.62 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  26.12 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  40 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  37.14 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  37.14 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  27.2 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  37.14 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  29.36 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.41 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  34.15 
 
 		 896 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1710  hypothetical protein  30.86 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  29.35 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.63 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.82 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3802  putative aminotransferase  28.83 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.08 
 
 		 409 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  29.77 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1489  cysteine desulfurase family protein  33.73 
 
 		 379 aa  53.5  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.742565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  20.92 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  26.61 
 
 		 422 aa  53.5  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0435  cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 409 aa  53.5  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.01 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  25.77 
 
 		 400 aa  53.5  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.21 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.93 
 
 		 413 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.93 
 
 		 413 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1710  hypothetical protein  32.86 
 
 		 387 aa  53.1  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1656  cysteine desulfurase IscS  25 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0819836  unclonable  0.0000556983 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  28.26 
 
 		 452 aa  52.8  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1276  cysteine desulfurase  34.29 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00157162  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1168  cysteine desulfurase  34.29 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00941489  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  35.23 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.4 
 
 		 673 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1122  aminotransferase, class V  28.92 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>