82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0914 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0914  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  700    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1032  hypothetical protein  92.26 
 
 		 349 aa  651    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.945584  normal  0.0182247 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1645  hypothetical protein  93.41 
 
 		 349 aa  662    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428665  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1032  hypothetical protein  73.91 
 
 		 353 aa  531  1e-150  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1149  hypothetical protein  49.48 
 
 		 414 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0457  hypothetical protein  25.07 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.764291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  24.24 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  26.2 
 
 		 355 aa  87.4  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  22.19 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  24.65 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  21.92 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0197  hypothetical protein  24.27 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  28 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1315  hypothetical protein  29.71 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0268  ornithine carbamoyltransferase  25.78 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.313188 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  21.18 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  30.73 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  30.21 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  22.03 
 
 		 900 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  22.03 
 
 		 914 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.99 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0554  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  25.48 
 
 		 528 aa  53.1  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00479073  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1384  hypothetical protein  25.89 
 
 		 295 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  29.69 
 
 		 302 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4563  carbamoyl phosphate synthase-like protein  24.55 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  21.61 
 
 		 900 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.4 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3436  hypothetical protein  22.97 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0385752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2306  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  24.86 
 
 		 1078 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  20.93 
 
 		 391 aa  49.3  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  32.39 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  29.9 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3069  protein of unknown function DUF201  21.9 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  25.71 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  25.71 
 
 		 356 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2438  hypothetical protein  23.79 
 
 		 410 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  24.41 
 
 		 301 aa  46.2  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  26.9 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2313  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.86 
 
 		 1079 aa  45.4  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.417995  normal  0.014378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2973  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.65 
 
 		 1162 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5257  protein of unknown function DUF201  19.53 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.04 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2897  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.16 
 
 		 1067 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  23.04 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0121  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.9 
 
 		 1075 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  33.33 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.04 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  23.04 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  27.05 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2576  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.16 
 
 		 1067 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1516  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.27 
 
 		 1109 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1864  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  22.62 
 
 		 1082 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000611023  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  25.13 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1650  hypothetical protein  23.15 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00343352  normal  0.111404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  23.53 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  20.44 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4605  carbamoyl phosphate synthase large subunit  24.76 
 
 		 1109 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.709642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3245  hypothetical protein  28.22 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.837509  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2491  D-alanine--D-alanine ligase  23.4 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1612  carbamoyl-phosphate synthase large subunit  23.67 
 
 		 1084 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6799  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.79 
 
 		 1154 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.896081 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0361  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.16 
 
 		 1109 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175688  normal  0.763709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1039  hypothetical protein  19.79 
 
 		 449 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2806  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.24 
 
 		 1077 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2712  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.3 
 
 		 1162 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.639063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  23.12 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1268  phosphoribosylglycinamide synthetase  28.57 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.584392  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0555  carbamoyl phosphate synthase large subunit  22.22 
 
 		 1074 aa  43.5  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770872  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.74 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  24.24 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  23.12 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  23.12 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  23.12 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  24.85 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02243  carbamoyl phosphate synthase large subunit  23.81 
 
 		 1073 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0257  hypothetical protein  26.02 
 
 		 346 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0421  hypothetical protein  28.57 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0143  phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2  20.83 
 
 		 392 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1774  hypothetical protein  28.07 
 
 		 312 aa  43.1  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  24.47 
 
 		 356 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2079  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit  23.67 
 
 		 1082 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0359545  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2432  hypothetical protein  24.04 
 
 		 430 aa  42.7  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>