30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0853 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  100 
 
 
470 aa  959    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  94.04 
 
 
469 aa  878    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  76.94 
 
 
474 aa  760    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  94.68 
 
 
470 aa  913    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1254  putative pseudouridylate synthase  55.9 
 
 
481 aa  527  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.367648  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  37.74 
 
 
428 aa  307  3e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  37.95 
 
 
431 aa  289  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  42.17 
 
 
409 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  42.7 
 
 
411 aa  276  5e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  42.94 
 
 
412 aa  276  7e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  40.78 
 
 
410 aa  276  7e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  38.15 
 
 
415 aa  260  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  36.36 
 
 
452 aa  259  7e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  40.63 
 
 
383 aa  253  6e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  36.34 
 
 
438 aa  244  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  33.68 
 
 
444 aa  236  6e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  37.39 
 
 
449 aa  232  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  34.69 
 
 
457 aa  229  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  37.2 
 
 
427 aa  227  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  35.11 
 
 
453 aa  228  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  32.18 
 
 
413 aa  193  6e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  31.32 
 
 
411 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  30.89 
 
 
411 aa  176  8e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  30.43 
 
 
411 aa  171  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29419  predicted protein  32.68 
 
 
276 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.444552  hitchhiker  0.00250662 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  26.51 
 
 
401 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0532  pseudouridylate synthase-like protein  26.96 
 
 
381 aa  125  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45108  predicted protein  30.49 
 
 
571 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1758  putative pseudouridylate synthase  25.61 
 
 
350 aa  64.7  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.293188 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  26.53 
 
 
370 aa  59.3  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>