100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0015 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1524  helicase c2  94.01 
 
 		 657 aa  1263    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00208913 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0007  helicase c2  92.92 
 
 		 653 aa  1246    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000554419 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0015  helicase c2  100 
 
 		 655 aa  1342    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0747117  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2213  helicase c2  22.73 
 
 		 644 aa  141  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23708 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0201  helicase c2  22.9 
 
 		 614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0888  helicase c2  34.91 
 
 		 466 aa  120  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2031  helicase c2  26.74 
 
 		 640 aa  106  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  26.09 
 
 		 583 aa  94  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  26.38 
 
 		 588 aa  89.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  24.07 
 
 		 832 aa  81.6  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  21.55 
 
 		 634 aa  72.8  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  22.53 
 
 		 957 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  22.24 
 
 		 921 aa  69.3  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  20.77 
 
 		 929 aa  68.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  23.32 
 
 		 709 aa  67  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  24.78 
 
 		 667 aa  65.9  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  20.41 
 
 		 930 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  20.51 
 
 		 641 aa  64.3  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  20.74 
 
 		 956 aa  64.3  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  20.93 
 
 		 843 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  19.76 
 
 		 639 aa  61.2  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  23.18 
 
 		 846 aa  61.2  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  20.06 
 
 		 944 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  19.19 
 
 		 840 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  18.5 
 
 		 660 aa  57.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.36 
 
 		 960 aa  57.4  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  24.29 
 
 		 640 aa  56.2  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0463  helicase c2  21.49 
 
 		 730 aa  56.2  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0718718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  20.2 
 
 		 843 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  22.88 
 
 		 699 aa  54.7  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  24.7 
 
 		 636 aa  54.7  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  23.11 
 
 		 668 aa  54.7  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  22.57 
 
 		 852 aa  54.3  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  20.56 
 
 		 830 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0371  DNA repair helicase RAD3  28.76 
 
 		 669 aa  53.5  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  19.17 
 
 		 649 aa  53.9  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  24.29 
 
 		 636 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  24.29 
 
 		 636 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  24.29 
 
 		 636 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  24.29 
 
 		 636 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  24.29 
 
 		 636 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  24.29 
 
 		 636 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  24.29 
 
 		 636 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  24.29 
 
 		 636 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  24.29 
 
 		 636 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  24.29 
 
 		 636 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0466  helicase c2  28.83 
 
 		 669 aa  52.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1453  helicase c2  28.83 
 
 		 669 aa  52.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  24.29 
 
 		 636 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  24.29 
 
 		 636 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  20.85 
 
 		 830 aa  51.6  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  24.03 
 
 		 636 aa  52  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  24.29 
 
 		 636 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  22.1 
 
 		 876 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0534  helicase c2  26.94 
 
 		 669 aa  51.2  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  24.69 
 
 		 639 aa  51.2  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  22.98 
 
 		 664 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  23.89 
 
 		 639 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  23.58 
 
 		 634 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  22.67 
 
 		 851 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  24.32 
 
 		 643 aa  50.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  23.58 
 
 		 634 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  23.58 
 
 		 634 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  22.89 
 
 		 640 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.1 
 
 		 720 aa  48.9  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0979  helicase domain-containing protein  27.4 
 
 		 706 aa  48.5  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0544879  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  22.61 
 
 		 684 aa  48.5  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  24.62 
 
 		 653 aa  48.1  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  25 
 
 		 646 aa  47.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  19.54 
 
 		 921 aa  48.1  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  24.07 
 
 		 651 aa  47.8  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  25.82 
 
 		 644 aa  47.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  29.2 
 
 		 822 aa  47.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  24.18 
 
 		 726 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.46 
 
 		 929 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  22.96 
 
 		 685 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1300  helicase c2  24.24 
 
 		 645 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1443  ATP-dependent helicase DinG  24.81 
 
 		 645 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1586  hypothetical protein  24.81 
 
 		 645 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1470  hypothetical protein  24.81 
 
 		 645 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  23.14 
 
 		 674 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1656  hypothetical protein  25.42 
 
 		 645 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.10694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  29.17 
 
 		 773 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  18.67 
 
 		 664 aa  45.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1442  ATP-dependent helicase DinG  25.42 
 
 		 645 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1902  helicase c2  23.93 
 
 		 646 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 		 934 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3725  hypothetical protein  24.81 
 
 		 645 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0167806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  20.68 
 
 		 664 aa  45.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.07 
 
 		 707 aa  45.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.93 
 
 		 934 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1486  helicase c2  25 
 
 		 645 aa  45.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.530371  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.1 
 
 		 714 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.1 
 
 		 714 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3091  hypothetical protein  29.9 
 
 		 163 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16004  normal  0.0284929 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2382  helicase c2  24.1 
 
 		 653 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.93 
 
 		 934 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1692  hypothetical protein  24.43 
 
 		 645 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  29.9 
 
 		 708 aa  43.9  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  20.95 
 
 		 677 aa  43.9  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>