110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1205 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 253 aa  521  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  96.05 
 
 		 253 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  92.09 
 
 		 253 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  71.83 
 
 		 254 aa  397  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  58.5 
 
 		 254 aa  301  5.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  34.38 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  31.42 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  32.44 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  30.15 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  29.57 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  29.66 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  27.55 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  29.96 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  28.14 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  26.14 
 
 		 328 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  28.24 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  27.59 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  27.97 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  27.13 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  26.17 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  28.03 
 
 		 380 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  28.34 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  29.34 
 
 		 267 aa  92  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  28.96 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  23.46 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  27.14 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  22.68 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  22.68 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  27.21 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  30.67 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  28.67 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  26.85 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0124  TatD family hydrolase  40.85 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  22.33 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00569  deoxyribonuclease  28.08 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  28.97 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  29.61 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2825  TatD-related deoxyribonuclease  27.33 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000784183  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  33.57 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  28.97 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1137  TatD-related deoxyribonuclease  25 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000948863  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  32.37 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  27.81 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  25.49 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  31.19 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  28.66 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0653  TatD-related deoxyribonuclease  29.73 
 
 		 265 aa  48.5  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0953194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  28.92 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  28.92 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3230  TatD-related deoxyribonuclease  27.15 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000015533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3369  TatD-related deoxyribonuclease  30.49 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0223431  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  40.51 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  39.36 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  37.84 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  24.18 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  22.69 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  24.18 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  27.21 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  24.18 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  24.18 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2730  TatD family hydrolase  34.48 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000196436  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  27.21 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  27.21 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  34.67 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  37.33 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  24.77 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  31.58 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  36.46 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  27.75 
 
 		 454 aa  46.2  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1038  TatD-related deoxyribonuclease  27.71 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000100963  unclonable  0.0000000000956605 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  28.85 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  33.7 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3381  TatD-related deoxyribonuclease  27.56 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000756036  hitchhiker  0.00541982 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  32.91 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0199  TatD family protein  34.72 
 
 		 237 aa  45.4  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  30.88 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  35.62 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  32.84 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl048  Mg2+ dependent DNAse  33.72 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  26.43 
 
 		 464 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1991  TatD-related deoxyribonuclease  25.79 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.126048  decreased coverage  0.0000779322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  27.66 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3003  TatD related DNase  26.71 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0100671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  26.51 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  32.89 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  32.84 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  32.84 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  24.83 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  27.1 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  27.7 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  34.57 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  30.57 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  34.09 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  32.91 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  34.33 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  24.35 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  40.91 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1022  TatD-related deoxyribonuclease  33.75 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  28.4 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  25 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>