More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0418 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0417  SufBD protein  95.2 
 
 		 408 aa  781    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0790554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1502  SufBD protein  95.45 
 
 		 408 aa  786    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0133685  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0489  SufBD protein  81.82 
 
 		 408 aa  694    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0418  SufBD protein  100 
 
 		 396 aa  811    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.365785  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0318  SufBD protein  69.13 
 
 		 406 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2451  SufBD protein  48.17 
 
 		 407 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.486482  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0490  SufBD  48.21 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000252968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2609  SufBD protein  45.54 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000309789  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1079  hypothetical protein  45.71 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1001  SufBD protein  47.27 
 
 		 390 aa  355  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36259  normal  0.0114053 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0163  SufBD protein  44.36 
 
 		 408 aa  345  6e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0535  SufBD protein  44.13 
 
 		 403 aa  342  8e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.283184  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0736  SufBD protein  45.74 
 
 		 411 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000212967  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0816  sufB/SufD domain-containing protein  44.82 
 
 		 411 aa  335  1e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_720  ABC-type transport system involved in Fe-S cluster assembly, permease component  45.1 
 
 		 411 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00654306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1810  SufBD protein  43.93 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.994131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1554  SufBD protein  44.08 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.114446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0915  SufBD protein  42.22 
 
 		 388 aa  322  5e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0351414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2224  SufBD protein  45.73 
 
 		 370 aa  322  9.000000000000001e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1444  hypothetical protein  42.97 
 
 		 386 aa  315  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0455588  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0259  SufBD protein  46.24 
 
 		 371 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1201  SufBD protein  42.48 
 
 		 384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.32638  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1370  SufBD protein  42.39 
 
 		 394 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0670  hypothetical protein  42.9 
 
 		 369 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1973  SufBD protein  43.24 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.409968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1923  SufBD protein  40.11 
 
 		 387 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2849  SufBD  44.2 
 
 		 369 aa  293  4e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0548  SufBD protein  39.09 
 
 		 368 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000312333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1531  SufBD protein  33.83 
 
 		 406 aa  257  3e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1085  SufBD protein  34.5 
 
 		 397 aa  229  4e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.533525  normal  0.253593 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0036  SufBD protein  34.59 
 
 		 398 aa  219  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0951  SufBD protein  37.13 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000136681  hitchhiker  0.000156509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0336  SufBD protein  31.19 
 
 		 441 aa  190  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  31.42 
 
 		 469 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  29.58 
 
 		 470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  31.02 
 
 		 463 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  30.83 
 
 		 465 aa  176  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  29.06 
 
 		 488 aa  175  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  29.26 
 
 		 471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  28.54 
 
 		 469 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  29.56 
 
 		 464 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  30.34 
 
 		 465 aa  173  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  30.34 
 
 		 465 aa  173  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  29.81 
 
 		 471 aa  172  9e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  29.31 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  27.99 
 
 		 468 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  29.35 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  28.65 
 
 		 467 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  29.08 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  29.08 
 
 		 472 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  28.76 
 
 		 470 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  27.18 
 
 		 467 aa  163  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  29.7 
 
 		 465 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  28.08 
 
 		 476 aa  162  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  29.7 
 
 		 465 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  29.7 
 
 		 465 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  29.02 
 
 		 469 aa  162  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  29.7 
 
 		 465 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  29.7 
 
 		 465 aa  162  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  29.7 
 
 		 465 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  29.7 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  29.7 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  30 
 
 		 465 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  29.44 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  29.77 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  27.56 
 
 		 476 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  29.76 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  30.56 
 
 		 483 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  27.99 
 
 		 472 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  29.22 
 
 		 470 aa  160  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  26.63 
 
 		 472 aa  160  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  28.08 
 
 		 470 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  29.47 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  26.51 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  27.44 
 
 		 480 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  29.26 
 
 		 479 aa  157  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  28.68 
 
 		 465 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  27.37 
 
 		 476 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  26.77 
 
 		 470 aa  156  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  27.37 
 
 		 475 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  27.27 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  28.86 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  27.18 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  27.74 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  27.01 
 
 		 479 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  26.51 
 
 		 470 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  27.03 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.97 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  27.6 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  27.45 
 
 		 471 aa  153  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  26.72 
 
 		 487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  27.65 
 
 		 470 aa  153  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  26.51 
 
 		 485 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  29.6 
 
 		 466 aa  153  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  27.54 
 
 		 470 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  27.98 
 
 		 478 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  26.96 
 
 		 481 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  26.96 
 
 		 481 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  26.51 
 
 		 472 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  26.3 
 
 		 476 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>