More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0351 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1433  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  95.79 
 
 		 380 aa  756    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.498854  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0486  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  95.79 
 
 		 380 aa  755    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0351  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  100 
 
 		 380 aa  779    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0554  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  85.45 
 
 		 381 aa  682    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0681  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  71.16 
 
 		 385 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0102  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 395 aa  349  5e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1440  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 387 aa  345  7e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1638  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 386 aa  338  7e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0796  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 459 aa  282  8.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1614  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 392 aa  272  7e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.193363  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1214  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 392 aa  259  6e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000547302  normal  0.0195225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1209  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0071  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0929376 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1163  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 462 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.937878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2180  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2045  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0348  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0463622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1050  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 392 aa  242  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0931794 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2291  cysteine desulfurase family protein  28.73 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  29.28 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  25.63 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  29.05 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0636  cysteine desulphurase-like protein  27.53 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.024881  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  27.39 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  27.39 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1458  cysteine desulfurase  37.21 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.586038  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  26.55 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0655  cysteine desulfurase family protein  27.39 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.696219  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  29.63 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.7 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.46 
 
 		 416 aa  59.3  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  36.17 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  30.91 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  38.16 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  38.16 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  38.16 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  36.84 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2696  cysteine desulfurase family protein  27.95 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  36.84 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  36.84 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2495  cysteine desulfurase family protein  27.1 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  36.84 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2983  cysteine desulfurase family protein  37.18 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2661  cysteine desulfurase family protein  37.18 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.146987  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  36.84 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0618  cysteine desulfurase family protein  28.95 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2402  cysteine desulfurase family protein  28.86 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3101  cysteine desulfurase family protein  29.14 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  38.03 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  36.84 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.26 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  30.37 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  37.04 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1293  cysteine desulfurase  38.16 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0405061 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  24.49 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  32.53 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3075  cysteine desulfurase family protein  25.88 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  26.41 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  25.15 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17050  selenocysteine lyase  25.95 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  28.41 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1692  cysteine desulfurase family protein  37.84 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.77 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  34.21 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0640  aminotransferase class V  21.72 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  24.86 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1912  selenocysteine lyase  26.12 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 407 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  37.14 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1710  hypothetical protein  32.89 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 392 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  35.23 
 
 		 414 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  34.21 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  27.82 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  35.53 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0234  selenocysteine lyase  25.77 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0249  Cysteine desulfurase  38.89 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  22.53 
 
 		 476 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  34.21 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1710  hypothetical protein  32.89 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  29.89 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0266  cysteine desulfurase family protein  39.47 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  34.21 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0435  cysteine desulfurase  35.71 
 
 		 409 aa  53.5  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.84 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  23.34 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.71 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  28.3 
 
 		 404 aa  52.8  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1276  cysteine desulfurase  34.29 
 
 		 409 aa  52.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00157162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>