More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2229 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2229  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 
284 aa  568  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.0161512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  57.45 
 
 
292 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  57.45 
 
 
292 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  60.28 
 
 
279 aa  314  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  57.71 
 
 
274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4501  cytochrome c oxidase subunit III  58.7 
 
 
291 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  60.07 
 
 
284 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  59.44 
 
 
284 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0833  cytochrome c oxidase, subunit III  60.42 
 
 
285 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  56.99 
 
 
292 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4792  cytochrome c oxidase, subunit III  60.42 
 
 
285 aa  294  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  57.8 
 
 
292 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  57.04 
 
 
293 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3454  cytochrome c oxidase subunit III  57.14 
 
 
285 aa  292  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0832287  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3258  cytochrome c oxidase subunit III  56.79 
 
 
285 aa  291  8e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.10566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3582  cytochrome c oxidase subunit III  56.79 
 
 
285 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2344  cytochrome c oxidase subunit III  57.09 
 
 
286 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.485775  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  57.09 
 
 
439 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  57.09 
 
 
292 aa  288  8e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0028  cytochrome c oxidase subunit III  55.83 
 
 
287 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117348  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  56.74 
 
 
292 aa  285  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0265  cytochrome c oxidase subunit III  54.42 
 
 
288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  59.93 
 
 
277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  59.72 
 
 
284 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1144  cytochrome c oxidase subunit III  55.16 
 
 
268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0228  cytochrome c oxidase, subunit III  58.04 
 
 
284 aa  266  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0766  cytochrome c oxidase, subunit III  58.04 
 
 
284 aa  266  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486485  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  53.74 
 
 
273 aa  259  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  54.12 
 
 
266 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0260  cytochrome c oxidase, subunit III  59.09 
 
 
284 aa  256  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3458  cytochrome c oxidase, subunit III  59.09 
 
 
284 aa  256  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1829  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit III  53.76 
 
 
266 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  53.76 
 
 
266 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  52.17 
 
 
291 aa  255  7e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1242  cytochrome c oxidase subunit III  56.23 
 
 
286 aa  252  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.993936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3151  cytochrome c oxidase, subunit III  51.77 
 
 
270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3880  cytochrome c oxidase, subunit III  50.88 
 
 
289 aa  239  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.351442  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2164  cytochrome c oxidase, subunit III  47.86 
 
 
283 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0676  cytochrome c oxidase, subunit III  46.24 
 
 
274 aa  228  1e-58  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0029  cytochrome c oxidase, subunit III  43.01 
 
 
274 aa  228  1e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  49.82 
 
 
271 aa  225  8e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0725  cytochrome c oxidase subunit III  54.09 
 
 
287 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0613182 
 
 
-
 
NC_002978  WD0141  cytochrome c oxidase, subunit III  43.66 
 
 
275 aa  223  4e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.400418  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0009  cytochrome c oxidase, subunit III  42.86 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  41.64 
 
 
291 aa  199  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  43.62 
 
 
288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  42.33 
 
 
288 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  39.42 
 
 
298 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
295 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  39.67 
 
 
295 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  41.36 
 
 
291 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 
295 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
295 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  39.41 
 
 
295 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  41.2 
 
 
291 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  39.41 
 
 
295 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  40.68 
 
 
284 aa  186  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  39.35 
 
 
295 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  40.2 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  38.98 
 
 
288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  46.72 
 
 
284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  38.59 
 
 
291 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  40.86 
 
 
291 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  42.86 
 
 
290 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  40.86 
 
 
291 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  40.27 
 
 
291 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  38.61 
 
 
296 aa  178  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  38.67 
 
 
291 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  39.87 
 
 
291 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  39.87 
 
 
291 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  39.87 
 
 
291 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  38.51 
 
 
297 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  38.59 
 
 
291 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  37.54 
 
 
295 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  40.27 
 
 
286 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  37.58 
 
 
291 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  39.53 
 
 
291 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  39.87 
 
 
291 aa  175  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  39.6 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  38.26 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  41.44 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  38.72 
 
 
289 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3486  cytochrome c oxidase subunit III  39 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  37.95 
 
 
286 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  39.06 
 
 
289 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  37.84 
 
 
293 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  37.79 
 
 
294 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  39.6 
 
 
293 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  38.78 
 
 
291 aa  168  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  40.34 
 
 
285 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  37.62 
 
 
286 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  38.61 
 
 
293 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  40 
 
 
285 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  38.87 
 
 
293 aa  165  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  36.42 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  40.34 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  40.34 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  40.34 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  40.34 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>