More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_23430 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_23430  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 
241 aa  467  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3932  16S rRNA methyltransferase GidB  63.73 
 
 
216 aa  249  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000765398 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4167  16S rRNA methyltransferase GidB  62.25 
 
 
228 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  56.41 
 
 
210 aa  201  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  52.61 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  54.68 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  51.76 
 
 
213 aa  185  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3590  methyltransferase GidB  50.75 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9051  16S rRNA methyltransferase GidB  48.61 
 
 
245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0166723  normal  0.835328 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  50.26 
 
 
210 aa  181  9.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  52.43 
 
 
225 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  53.06 
 
 
223 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3374  methyltransferase GidB  48.98 
 
 
242 aa  176  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9385  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase involved in cell division-like protein  48.74 
 
 
236 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  50.79 
 
 
241 aa  174  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4238  methyltransferase GidB  50 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  58.97 
 
 
237 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  46.5 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4859  methyltransferase GidB  52.15 
 
 
205 aa  172  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4695  methyltransferase GidB  50.53 
 
 
250 aa  171  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0675107  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  47.6 
 
 
242 aa  168  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  48.48 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  48.99 
 
 
227 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13954  16S rRNA methyltransferase GidB  46.08 
 
 
224 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5784  16S rRNA methyltransferase GidB  46.86 
 
 
225 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5408  16S rRNA methyltransferase GidB  47.24 
 
 
225 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  47.24 
 
 
225 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894552  normal  0.113174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4542  16S rRNA methyltransferase GidB  46.77 
 
 
265 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5106  16S rRNA methyltransferase GidB  48.05 
 
 
242 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000203893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  48.85 
 
 
223 aa  155  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  42.08 
 
 
221 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7334  16S rRNA methyltransferase GidB  42.31 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  41.23 
 
 
255 aa  150  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  44.55 
 
 
262 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4863  methyltransferase GidB  53.85 
 
 
236 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0314819  normal  0.0271689 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3722  methyltransferase GidB  49.12 
 
 
228 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000000027143  hitchhiker  0.00000187347 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  50.55 
 
 
222 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4220  methyltransferase GidB  44.33 
 
 
212 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  40.57 
 
 
209 aa  102  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0345  16S rRNA methyltransferase GidB  30.93 
 
 
239 aa  95.9  5e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  38.61 
 
 
208 aa  95.5  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0112  cell division SAM-dependent methyltransferase  31.36 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2517  methyltransferase GidB  28.72 
 
 
240 aa  90.1  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00460923  hitchhiker  0.00173513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  30.89 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  32.75 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  32.75 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  32.75 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  32.75 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  32.75 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  32.75 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2989  16S rRNA methyltransferase GidB  29.17 
 
 
239 aa  89.4  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  32.75 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  32.75 
 
 
207 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4955  methyltransferase GidB  29.06 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000894491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3084  16S rRNA methyltransferase GidB  36.53 
 
 
238 aa  89  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.247732  unclonable  0.0000000260442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  38.41 
 
 
208 aa  89  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  32.54 
 
 
214 aa  88.6  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  32.75 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2667  16S rRNA methyltransferase GidB  28.65 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3427  16S rRNA methyltransferase GidB  27.64 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1466  16S rRNA methyltransferase GidB  28.49 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.561264  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_12955  predicted protein  42.15 
 
 
205 aa  86.3  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  37.28 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0005  16S rRNA methyltransferase GidB  26.47 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.194064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3322  methyltransferase GidB  29.95 
 
 
240 aa  85.9  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  31.98 
 
 
206 aa  85.9  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  29.15 
 
 
241 aa  85.5  6e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826958  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  33.14 
 
 
207 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0223  methyltransferase GidB  34.91 
 
 
228 aa  85.9  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  35.1 
 
 
207 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  35.1 
 
 
207 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  35.1 
 
 
207 aa  85.5  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  35.1 
 
 
207 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4363  methyltransferase GidB  37.59 
 
 
236 aa  85.1  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  33.77 
 
 
206 aa  85.1  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_682  methyltransferase  31.84 
 
 
235 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  33.77 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3051  methyltransferase GidB  31.84 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.014233  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  33.77 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  33.09 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  36.26 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1744  16S rRNA methyltransferase GidB  27.72 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000198478  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3939  methyltransferase GidB  29.48 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  33.1 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2407  16S rRNA methyltransferase GidB  28.28 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  27.78 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  37.1 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4009  methyltransferase GidB  36.97 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00213525  hitchhiker  0.00000000363002 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2035  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00382628  normal  0.306355 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  34.23 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2147  methyltransferase GidB  39.29 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0221  methyltransferase GidB  34.12 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  30.61 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  33.11 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  32.16 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  32.68 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  30.67 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0154  methyltransferase GidB  34.12 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0574713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2216  16S rRNA methyltransferase GidB  38.03 
 
 
234 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  40.95 
 
 
214 aa  82  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>