More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_03250 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_03250  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  100 
 
 		 348 aa  682    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.243016  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0745  pseudouridine synthase  49.57 
 
 		 326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0617  pseudouridine synthase  48.84 
 
 		 314 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2906  pseudouridine synthase  42.04 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1895  pseudouridine synthase  40.06 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28660  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  43.5 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.727795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4309  pseudouridine synthase  41.33 
 
 		 310 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38090  putative pseudouridylate synthase  41.11 
 
 		 300 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4738  pseudouridine synthase  40.23 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2937  pseudouridine synthase  40.12 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.519419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5332  pseudouridine synthase  41.69 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.776192  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4820  pseudouridine synthase  41.3 
 
 		 286 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0140866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0672  pseudouridine synthase  42.17 
 
 		 309 aa  209  7e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1621  pseudouridine synthase  40.58 
 
 		 285 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0554  pseudouridine synthase  42.68 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2674  pseudouridine synthase  39.88 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0930515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1453  pseudouridine synthase  39.41 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2605  pseudouridine synthase  40 
 
 		 314 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2349  RNA pseudouridine synthase family protein  39.88 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189292  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1531  pseudouridine synthase  37.27 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  0.216028 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1652  pseudouridine synthase  39.58 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1278  pseudouridine synthase  41.67 
 
 		 287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175088 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2133  pseudouridine synthase  38.96 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3629  pseudouridine synthase  39.94 
 
 		 301 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1629  pseudouridine synthase  40.18 
 
 		 294 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3964  pseudouridine synthase  38.96 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3244  RNA pseudouridine synthase family protein  41.01 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0639  pseudouridine synthase  40.63 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4011  pseudouridine synthase  38.4 
 
 		 305 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1251  pseudouridine synthase  41.07 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.375028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1268  pseudouridine synthase  41.07 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3559  pseudouridine synthase  41.43 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1330  pseudouridine synthase  35.12 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0166738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20160  RNA pseudouridine synthase family protein  40 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0431  pseudouridine synthase  39.88 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4251  pseudouridine synthase  37.94 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00270285  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1623  pseudouridine synthase  40 
 
 		 292 aa  189  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.449518  normal  0.260522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1777  pseudouridine synthase  37.54 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2953  pseudouridine synthase  34.48 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13329  hypothetical protein  42.71 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3348  pseudouridine synthase  34.96 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0242654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3557  pseudouridine synthase  32.22 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.656396  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0482  pseudouridine synthase  32.91 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0932  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  41.51 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0418  pseudouridine synthase  34.92 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0257  pseudouridine synthase  33.86 
 
 		 293 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0506  pseudouridine synthase  35.48 
 
 		 309 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08660  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  37.82 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0572  pseudouridine synthase  34.52 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0459  pseudouridine synthase  34.08 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0549  pseudouridine synthase  33.66 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0445  pseudouridine synthase  33.76 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1212  pseudouridine synthase  34.13 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3537  pseudouridine synthase  34.29 
 
 		 308 aa  166  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.966501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3712  pseudouridine synthase  33.02 
 
 		 305 aa  166  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0433  pseudouridine synthase  33.44 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3881  pseudouridine synthase  33.44 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.792189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4073  pseudouridine synthase  34.19 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0519  pseudouridine synthase  32.8 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08910  23S RNA-specific pseudouridylate synthase  35.57 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.267328  normal  0.027473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02575  pseudouridylate synthase  38.8 
 
 		 206 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5191  pseudouridine synthase, RluA family  29.08 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000721787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3242  pseudouridine synthase, RluA family  27.78 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  normal  0.607359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  30.68 
 
 		 560 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2882  RluA family pseudouridine synthase  28.53 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3978  pseudouridine synthase, RluA family  26.27 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1377  pseudouridylate synthase  29.41 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1442  pseudouridylate synthase  30.31 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81175  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4020  pseudouridine synthase, RluA family  25.18 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0375  RluA family pseudouridine synthase  25.63 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000429003  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1813  pseudouridine synthase, RluA family  28.38 
 
 		 526 aa  72.8  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000964916  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2426  pseudouridine synthase  31.39 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.181942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1430  pseudouridine synthase  29.92 
 
 		 223 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0066  pseudouridine synthase  34.6 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.22289  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1515  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  26.56 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00972645  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1592  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  30.04 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1276  pseudouridine synthase  31.7 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.220673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0516  pseudouridine synthase  30.04 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.69 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.397176 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0606  pseudouridylate synthase  27.24 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0791  pseudouridine synthase  28.86 
 
 		 204 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00896147  normal  0.0723816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3654  pseudouridine synthase  30.23 
 
 		 225 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1467  pseudouridine synthase  28 
 
 		 217 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0107  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  27.73 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000191196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0100  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  27.73 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal  0.810633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0101  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  27.73 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00188355  normal  0.0335495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2488  pseudouridylate synthase  27.24 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177305  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0102  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  27.73 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0105  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase A  27.73 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3067  pseudouridine synthase  30.74 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2192  pseudouridine synthase  26.89 
 
 		 226 aa  67  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0267  tRNA pseudouridine synthase C  30.84 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1374  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.57 
 
 		 543 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1324  pseudouridine synthase, RluA family  24.76 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0854  tRNA pseudouridine synthase C  29.53 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219419  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1328  pseudouridine synthase RluA-like  27.07 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1096  pseudouridylate synthase  30.16 
 
 		 232 aa  67  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3106  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  28.11 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.774477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2968  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  27.34 
 
 		 224 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1736  pseudouridine synthase  30.92 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.175202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>