44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2219 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 109 aa  214  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  43.27 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.05 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  37.65 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  41.18 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2098  putative anti-sigma B factor antagonist  35.56 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  32.53 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  31.03 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0557  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.102559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57830  hypothetical protein  35.87 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.03 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0382  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.9374  normal  0.215412 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  32.14 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1895  NTP binding protein  40 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  36.36 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0764  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4532  STAS domain-containing protein  31.11 
 
 		 100 aa  50.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5807  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.78678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4137  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.48 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0880  anti-sigma-factor antagonist  38.2 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  31.07 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1029  anti-sigma-factor antagonist  31.37 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3397  NTP binding protein  32.22 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3366  SpoIIAA family protein  35.96 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  30.77 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  30.77 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  30.77 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  30.77 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  30.77 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3646  putative anti-sigma B factor antagonist  33.71 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3339  SpoIIAA family protein  31.87 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  32.22 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  30.43 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0252  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00491893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0683  SpoIIAA family protein  33.75 
 
 		 94 aa  42  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  41.51 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0682  SpoIIAA family protein  37.04 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0924977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12890  STAS family protein  31.87 
 
 		 102 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0471  anti-sigma-factor antagonist  32.1 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00988083  hitchhiker  0.0000661434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3950  SpoIIAA family protein  30.77 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  26.97 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>