82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1758 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  100 
 
 
524 aa  1070    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  63.84 
 
 
638 aa  420  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  57.63 
 
 
781 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  38.72 
 
 
522 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  34.91 
 
 
512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  35.37 
 
 
522 aa  280  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  32.64 
 
 
542 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  35.14 
 
 
521 aa  273  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  35.27 
 
 
509 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  34.89 
 
 
522 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  33.03 
 
 
514 aa  266  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  33.88 
 
 
514 aa  266  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  34.84 
 
 
522 aa  265  1e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  33.57 
 
 
521 aa  263  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  33.87 
 
 
518 aa  261  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  33.45 
 
 
544 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  33.1 
 
 
521 aa  231  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  33.27 
 
 
521 aa  229  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  29.64 
 
 
551 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  39.17 
 
 
644 aa  216  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  42.09 
 
 
585 aa  216  8e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  30.42 
 
 
569 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  40.54 
 
 
660 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  39.21 
 
 
802 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  38.44 
 
 
596 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  46.12 
 
 
690 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  37.88 
 
 
401 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  35.74 
 
 
724 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  33.5 
 
 
821 aa  183  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  28.39 
 
 
509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  28.39 
 
 
509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  37.81 
 
 
1117 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  36.67 
 
 
599 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  27.77 
 
 
509 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  37.23 
 
 
405 aa  167  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  33.76 
 
 
470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  42.71 
 
 
649 aa  158  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  26.98 
 
 
500 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  41.58 
 
 
478 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  41.97 
 
 
700 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  32.81 
 
 
498 aa  147  6e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  29.79 
 
 
585 aa  147  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  43.66 
 
 
405 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  37.07 
 
 
402 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  32.26 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  40 
 
 
697 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  30.99 
 
 
394 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  41.24 
 
 
479 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  40 
 
 
497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  28.74 
 
 
740 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  28.51 
 
 
740 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  36.73 
 
 
517 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  37.57 
 
 
517 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  35.27 
 
 
522 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  32.94 
 
 
686 aa  109  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  33.01 
 
 
499 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  33.01 
 
 
499 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  32.58 
 
 
734 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  27.56 
 
 
400 aa  60.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  26.59 
 
 
405 aa  60.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  23.44 
 
 
387 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  28.26 
 
 
474 aa  52  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  24.04 
 
 
389 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1212  tail sheath protein  25.45 
 
 
388 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.562456  hitchhiker  0.00316448 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  27.27 
 
 
392 aa  50.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  26.74 
 
 
392 aa  50.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3038  hypothetical protein  33.68 
 
 
534 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000011603 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  27.27 
 
 
392 aa  50.1  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  27.44 
 
 
475 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  29.19 
 
 
476 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  28.36 
 
 
485 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  27.44 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  23.94 
 
 
388 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2213  major tail sheath protein  26.88 
 
 
501 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4469  phage tail sheath protein  27.91 
 
 
475 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4553  phage tail sheath protein  27.91 
 
 
475 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.558981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  27.72 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  25.74 
 
 
386 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  28.97 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  24.45 
 
 
388 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  29.1 
 
 
478 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  24.32 
 
 
398 aa  43.5  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>