More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1714 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  100 
 
 		 227 aa  471  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2474  methyltransferase type 12  42.92 
 
 		 245 aa  211  9e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0233  Methyltransferase type 12  40.66 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3127  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 		 248 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  29.88 
 
 		 541 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2441  hypothetical protein  31.17 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000635831  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7225  hypothetical protein  32.78 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23251  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2518  hypothetical protein  29.96 
 
 		 248 aa  119  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.48 
 
 		 541 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  29.48 
 
 		 541 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  29.48 
 
 		 541 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2481  hypothetical protein  31.33 
 
 		 248 aa  118  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.873205  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  29.08 
 
 		 541 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1076  hypothetical protein  29.44 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0783681  normal  0.62878 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2761  Methyltransferase type 12  30.49 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3509  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3046  SAM-dependent methyltransferase  29.55 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0791  hypothetical protein  28.74 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04172  predicted methyltransferase  29.39 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3693  Methyltransferase type 11  29.39 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04134  hypothetical protein  29.39 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3211  methyltransferase type 11  31.17 
 
 		 248 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2793  hypothetical protein  30.36 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1432  hypothetical protein  29.96 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1856  hypothetical protein  29.96 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  0.598585 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3907  methyltransferase  27.76 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1796  hypothetical protein  27.53 
 
 		 248 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.655049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48790  hypothetical protein  29.84 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4048  methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2143  methyltransferase  27.6 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  27.35 
 
 		 248 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2834  methyltransferase type 12  28.81 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  42.39 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  42.39 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  42.39 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2662  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  30.48 
 
 		 371 aa  61.6  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.360692  normal  0.0481393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  33.11 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.44 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  42.55 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5271  Methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  39.13 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  35.51 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  28.14 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  28.36 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0726  methionine biosynthesis protein MetW  39.13 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1748  hypothetical protein  23.08 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.245631 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  36.96 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0574  methionine biosynthesis protein MetW  36.96 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  35.24 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  25.52 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1199  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  37.36 
 
 		 372 aa  55.1  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1147  methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2870  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  41.03 
 
 		 482 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3681  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 392 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2223  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  38.57 
 
 		 385 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.399173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0215  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.66 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.303919 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2741  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  31.87 
 
 		 400 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2136  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.6 
 
 		 457 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000408941 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1480  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  27.72 
 
 		 387 aa  52.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5006  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.29 
 
 		 413 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.20351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2673  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  36.96 
 
 		 384 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.826358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  32.17 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 280 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1527  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.16 
 
 		 394 aa  52.4  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.58 
 
 		 255 aa  52  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  26.7 
 
 		 251 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.77 
 
 		 434 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.93 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1446  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  34.07 
 
 		 388 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220597  normal  0.530615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  33.7 
 
 		 419 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1190  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.33 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  37.18 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 391 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  35.85 
 
 		 394 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  31.95 
 
 		 269 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  35.96 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1341  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  36.11 
 
 		 394 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  38.2 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 360 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2433  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.95 
 
 		 419 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.419003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08370  methyltransferase, cyclopropane fatty acid synthase  29.57 
 
 		 422 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0384  methionine biosynthesis protein MetW  36.62 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  33.33 
 
 		 273 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 341 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 341 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 280 aa  49.3  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.25 
 
 		 420 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 341 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2133  methionine biosynthesis protein MetW  26.97 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1253  hypothetical protein  33.67 
 
 		 255 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4493  hypothetical protein  32.43 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.809793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>