More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5719 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5289  response regulator receiver protein  100 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125341 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5719  response regulator receiver protein  100 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3653  response regulator receiver protein  100 
 
 		 230 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0901  response regulator receiver protein  88.26 
 
 		 230 aa  361  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2842  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 292 aa  237  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1446  response regulator receiver protein  55.95 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1464  response regulator receiver protein  55.95 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4558  response regulator receiver protein  57.46 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  39.74 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  36.64 
 
 		 251 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  37.71 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 240 aa  104  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  34.39 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4507  two component transcriptional regulator  51.04 
 
 		 246 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  35.53 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  34.89 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  35.96 
 
 		 334 aa  95.9  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2842  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.77 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  34.76 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  35.19 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.39 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  36.05 
 
 		 263 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  36.05 
 
 		 263 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  36.05 
 
 		 263 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  29 
 
 		 234 aa  93.2  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  31.6 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.76 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.2 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  29.78 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.14 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.22 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.33 
 
 		 279 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  33.92 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  36.02 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  34.21 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.8 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  34.21 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  34.48 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  25.97 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  32.16 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  36.91 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  35.68 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  32.6 
 
 		 224 aa  88.6  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  33.19 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  29.26 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  34.06 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.39 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.33 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.5 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  30.6 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  33.48 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  30.13 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.51 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  29.69 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  28.33 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  35.22 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  27.63 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  28.07 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  28.07 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  28.07 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.87 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  27.63 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  27.63 
 
 		 233 aa  85.1  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  27.63 
 
 		 233 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  26.75 
 
 		 234 aa  85.1  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1024  two component transcriptional regulator  26.64 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  36.02 
 
 		 232 aa  85.1  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.94 
 
 		 227 aa  85.5  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  29.71 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  27.92 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  32.49 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6788  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.74 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241896 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  29.69 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  32.75 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  32.31 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1280  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.9 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>