More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0336 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0326  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
279 aa  550  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
279 aa  550  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
279 aa  550  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.246664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.82 
 
 
281 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.312689  normal  0.137011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1565  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.92 
 
 
281 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.4 
 
 
290 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53721  normal  0.207776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.42 
 
 
288 aa  289  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5253  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.54 
 
 
273 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.36 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4851  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
256 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4896  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
255 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0462854  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2114  3 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase/carbonyl reductase  39.78 
 
 
259 aa  159  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4503  reductase  42.25 
 
 
267 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  38.17 
 
 
263 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1517  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
263 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1147  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 
295 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
259 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
258 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
238 aa  92  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  28.41 
 
 
259 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  31.11 
 
 
255 aa  85.5  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  29.85 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  30.3 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  32.21 
 
 
516 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0325  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.31 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2450  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.22 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0588797  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0010  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  30.3 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0013  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  30.3 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4440  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609923  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.85 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.36 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  28.04 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4796  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.27 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.616684  normal  0.0456615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4279  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4885  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.56 
 
 
261 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726379 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
251 aa  72  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5275  short chain dehydrogenase  27.59 
 
 
239 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.67 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3453  short chain dehydrogenase  27.59 
 
 
239 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2733  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.5 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.08 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.74 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0504  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.96 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.2 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3977  short chain dehydrogenase  26.44 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0505376 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.41 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0711669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19021  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1067  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.41 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0129  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.06 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0445415  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.806753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  27.88 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  28.32 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.685606  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.36 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06655  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03520)  35.66 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  27.78 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  28.31 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.29 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0703114  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02177  short chain dehydrogenase/oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15740)  25 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6985  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3149  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
226 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
248 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_004310  BR0116  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.27 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.68 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.33 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21608  predicted protein  26.88 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01741  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family protein  23.25 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.64 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2285  acetoacetyl-CoA reductase  30.66 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853533 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3542  short chain dehydrogenase  26.44 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.71416 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.47 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.96 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.890933  normal  0.0516654 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  25.96 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138252  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  25.96 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>