More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4959 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4959  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4576  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  97.9 
 
 
286 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4664  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  97.9 
 
 
286 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5155  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  75.35 
 
 
290 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1602  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  77.06 
 
 
284 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10785  dehydrogenase/reductase  64.77 
 
 
295 aa  327  9e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3849  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.69 
 
 
291 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3694  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  35.32 
 
 
272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.450315  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3767  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.32 
 
 
272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  35.21 
 
 
296 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.21 
 
 
296 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  35.21 
 
 
294 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  35.21 
 
 
294 aa  132  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  35.21 
 
 
294 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  35.21 
 
 
296 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  35.21 
 
 
294 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  35.21 
 
 
294 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  35.21 
 
 
296 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4173  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.38 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392331  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3707  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  34.86 
 
 
272 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.608157  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.21 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  33.1 
 
 
296 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  33.1 
 
 
296 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  33.1 
 
 
296 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  33.1 
 
 
296 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  33.1 
 
 
296 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1968  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.55 
 
 
298 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.54 
 
 
292 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1409  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.5 
 
 
284 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0135816  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05191  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.54 
 
 
292 aa  122  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4221  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.41 
 
 
294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2481  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.96 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  34.93 
 
 
290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.5 
 
 
294 aa  119  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0210  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.36 
 
 
284 aa  118  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.27 
 
 
292 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.07 
 
 
300 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2971  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.2 
 
 
301 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.19 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  33.45 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.7 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4279  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.58 
 
 
264 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2415  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.5 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.942555  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.33 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3256  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.74 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0657335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  30.4 
 
 
296 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0123  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.28 
 
 
315 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01903  putative oxidoreductase  34.25 
 
 
291 aa  112  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0245  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32 
 
 
304 aa  112  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  34.51 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1304  6-phosphogluconate dehydrogenase  30 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.55 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 
303 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2927  tartronate semialdehyde reductase  36.88 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.378474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3060  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.67 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1917  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.49 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  33.8 
 
 
294 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2197  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.07 
 
 
290 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206144  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5012  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35 
 
 
290 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210845  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1318  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.18 
 
 
291 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0972  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.33 
 
 
303 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.312001  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3196  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.34 
 
 
296 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788547 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0699  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.8 
 
 
286 aa  108  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000621245 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2391  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.45 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.633873  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1728  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.67 
 
 
296 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1371  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.93 
 
 
307 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.506801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3525  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.07 
 
 
296 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.014061  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0284  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.51 
 
 
292 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.34 
 
 
309 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2366  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.12 
 
 
301 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1251  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.35 
 
 
298 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1101  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.84 
 
 
290 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3126  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.83 
 
 
300 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1265  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.55 
 
 
284 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.92382  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2554  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  34.18 
 
 
291 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0333948  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.64 
 
 
297 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.12 
 
 
296 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2700  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.15 
 
 
302 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  34.51 
 
 
294 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2461  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  33.94 
 
 
291 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243113  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.09 
 
 
291 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3283  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.98 
 
 
278 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4518  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.38 
 
 
308 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.431597  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1337  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.58 
 
 
290 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0431672  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1587  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.99 
 
 
291 aa  105  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.169784  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4459  NADP oxidoreductase  32.14 
 
 
291 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00439637  normal  0.0523521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1800  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  34.18 
 
 
288 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.83 
 
 
288 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2192  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.2 
 
 
296 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.2 
 
 
296 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0387103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2115  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.2 
 
 
296 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7141  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.7 
 
 
303 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2353  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.2 
 
 
296 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6449  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.61 
 
 
311 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00013981  hitchhiker  2.49994e-16 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3695  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  36.78 
 
 
272 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1360  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.7 
 
 
290 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117709  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3768  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  36.78 
 
 
272 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2160  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.83 
 
 
296 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.04 
 
 
309 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2372  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.83 
 
 
296 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>