More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5155 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5155  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
290 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1602  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  88.89 
 
 
284 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4576  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  75 
 
 
286 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4959  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  75.35 
 
 
286 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4664  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  75 
 
 
286 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147523  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10785  dehydrogenase/reductase  65.38 
 
 
295 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3849  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.86 
 
 
291 aa  306  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3694  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  38.81 
 
 
272 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.450315  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3767  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  38.81 
 
 
272 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4173  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  39.91 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392331  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3707  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  38.81 
 
 
272 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.608157  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2481  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  38.5 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4279  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.58 
 
 
264 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0210  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.55 
 
 
284 aa  127  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4221  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.27 
 
 
294 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  34.57 
 
 
294 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  34.57 
 
 
296 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.57 
 
 
296 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  34.57 
 
 
294 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  34.57 
 
 
294 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  34.57 
 
 
294 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  34.57 
 
 
294 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  34.57 
 
 
296 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  34.57 
 
 
296 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  33.46 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.32 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  33.46 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  33.46 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  33.46 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  33.46 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0699  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.72 
 
 
286 aa  119  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000621245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1917  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.93 
 
 
298 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0284  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.48 
 
 
292 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2366  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.07 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.45 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  36.43 
 
 
294 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  33.46 
 
 
296 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1265  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32 
 
 
284 aa  112  9e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.92382  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0123  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.93 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.45 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5012  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.07 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210845  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2461  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  33.08 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243113  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1587  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.21 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.169784  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2391  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.09 
 
 
291 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.633873  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05191  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.54 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1968  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.7 
 
 
298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2415  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.6 
 
 
315 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.942555  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.04 
 
 
292 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.32 
 
 
309 aa  109  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.32 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  33.83 
 
 
294 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.85 
 
 
298 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2554  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.45 
 
 
291 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0333948  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3283  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.79 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.32 
 
 
303 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4985  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.36 
 
 
289 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888648  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5125  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.72 
 
 
293 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.161405 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1453  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.81 
 
 
296 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.49 
 
 
293 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.7 
 
 
303 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1409  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.85 
 
 
284 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0135816  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0236  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.49 
 
 
284 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355607  normal  0.156106 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1800  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  31.73 
 
 
288 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3295  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.71 
 
 
293 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  32.08 
 
 
289 aa  106  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.33 
 
 
294 aa  106  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0768  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.32 
 
 
295 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4459  NADP oxidoreductase  31.29 
 
 
291 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00439637  normal  0.0523521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2568  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.08 
 
 
291 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.138617  hitchhiker  0.00176659 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1724  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.08 
 
 
291 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3695  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  35.71 
 
 
272 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1542  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 
297 aa  106  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0206535  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3768  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.71 
 
 
272 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.921478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1360  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.96 
 
 
290 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117709  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1045  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  36.1 
 
 
305 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0255982  normal  0.0907231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1721  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.08 
 
 
291 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00783731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3126  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.08 
 
 
300 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0245  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.28 
 
 
298 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1764  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.08 
 
 
291 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.438738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.78 
 
 
288 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.95 
 
 
291 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.84 
 
 
292 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0803  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.62 
 
 
302 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0115  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.36 
 
 
289 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0693  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  33.71 
 
 
305 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.682361  normal  0.0958689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1062  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.95 
 
 
290 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  36.55 
 
 
290 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.28 
 
 
297 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468786 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1078  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.95 
 
 
290 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0733755 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.61 
 
 
301 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01903  putative oxidoreductase  32.26 
 
 
291 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  30.94 
 
 
296 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0073  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.86 
 
 
300 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2821  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.49 
 
 
289 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1101  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.22 
 
 
290 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4666  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.36 
 
 
295 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534341  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.6 
 
 
298 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.36 
 
 
295 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0233897  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.95 
 
 
290 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1304  6-phosphogluconate dehydrogenase  27.34 
 
 
298 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>