183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1958 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1978  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
272 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2024  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
272 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1958  acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
272 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.769935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2198  acyl-CoA thioesterase  75 
 
 
273 aa  374  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.164433  normal  0.878138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4143  acyl-CoA thioesterase  73.8 
 
 
271 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3803  Choloyl-CoA hydrolase  35.44 
 
 
291 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  hitchhiker  0.0012585 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2732  palmitoyl-CoA hydrolase  32.98 
 
 
281 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0611615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2851  palmitoyl-CoA hydrolase  36.75 
 
 
288 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24760  acyl-CoA thioesterase II  33.81 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1316  palmitoyl-CoA hydrolase  33.45 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.478481  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4768  Palmitoyl-CoA hydrolase  34.28 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3069  acyl-CoA thioesterase II  33.57 
 
 
314 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000238384  hitchhiker  0.00469721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08940  acyl-CoA thioesterase  32.2 
 
 
323 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.271356  normal  0.0733048 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3159  palmitoyl-CoA hydrolase  34.27 
 
 
294 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0078  acyl-CoA thioesterase  31.1 
 
 
300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0521251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3384  palmitoyl-CoA hydrolase  34.49 
 
 
294 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1819  acyl-CoA thioesterase II  31.83 
 
 
293 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2592  Choloyl-CoA hydrolase  37.02 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0205084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2373  Palmitoyl-CoA hydrolase  32.62 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.394315 
 
 
-
 
NC_004310  BR1898  acyl-CoA thioesterase II  30.66 
 
 
311 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2097  acyl-CoA thioesterase II  32.62 
 
 
287 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  hitchhiker  0.00217835 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1825  acyl-CoA thioesterase II  30.63 
 
 
300 aa  133  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.115581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3590  palmitoyl-CoA hydrolase  33.1 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1166  acyl-CoA thioesterase II  31.82 
 
 
289 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3055  acyl-CoA thioesterase II  31.87 
 
 
287 aa  132  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1111  acyl-CoA thioesterase II  31.54 
 
 
287 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000604466  hitchhiker  0.00000208414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3590  acyl-CoA thioesterase  32.52 
 
 
286 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0111509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0087  acyl-CoA thioesterase II  29.82 
 
 
286 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0787884  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4293  Acyl-CoA thioesterase  31.14 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2049  acyl-CoA thioesterase II  31.54 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280365  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0920  acyl-CoA thioesterase II  31.89 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2939  acyl-CoA thioesterase  32.4 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12870  acyl-CoA thioesterase II  31.47 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.18518  normal  0.438746 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1005  acyl-CoA thioesterase II  31.08 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.129501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07750  acyl-CoA thioesterase II  33.84 
 
 
290 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0958  acyl-CoA thioesterase II  30.34 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2825  acyl-CoA thioesterase  33.46 
 
 
293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3009  acyl-CoA thioesterase  32.36 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5686  acyl-CoA thioesterase II  31.54 
 
 
310 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5500  acyl-CoA thioesterase II  33.47 
 
 
289 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.215107  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2850  acyl-CoA thioesterase II  31.34 
 
 
296 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105519  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3041  acyl-CoA thioesterase  33.21 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.291643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3100  acyl-CoA thioesterase  33.21 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0180741  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3057  acyl-CoA thioesterase  33.21 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0508  acyl-CoA thioesterase II  32.27 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2994  acyl-CoA thioesterase  32 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2417  palmitoyl-CoA hydrolase  33.45 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00372623  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4240  acyl-CoA thioesterase II  29.66 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0505  acyl-CoA thioesterase II  32.27 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3038  acyl-CoA thioesterase  32 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.683464  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0524  acyl-CoA thioesterase II  32.27 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.602046  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0297  acyl-CoA thioesterase II  28.77 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.372067 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00404  acyl-CoA thioesterase II  32.67 
 
 
286 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3157  acyl-CoA thioesterase II  32.67 
 
 
286 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.46101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0541  acyl-CoA thioesterase II  32.67 
 
 
286 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0909555  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0488  acyl-CoA thioesterase II  32.67 
 
 
286 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0529  acyl-CoA thioesterase II  32.67 
 
 
286 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3163  acyl-CoA thioesterase II  32.67 
 
 
286 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0379  acyl-CoA thioesterase II  32.67 
 
 
286 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0496  acyl-CoA thioesterase II  32.67 
 
 
286 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1035  palmitoyl-CoA hydrolase  34.94 
 
 
308 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4636  acyl-CoA thioesterase II  33.85 
 
 
289 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0147271  hitchhiker  0.00276811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3628  acyl-CoA thioesterase II  31.1 
 
 
299 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00408  hypothetical protein  32.67 
 
 
286 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0567  acyl-CoA thioesterase II  31.87 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4774  acyl-CoA thioesterase II  33.72 
 
 
289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0463605  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0514  acyl-CoA thioesterase II  31.87 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3771  acyl-CoA thioesterase II  30.14 
 
 
294 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529792  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4762  acyl-CoA thioesterase II  33.46 
 
 
289 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000102019  decreased coverage  0.000737933 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4827  acyl-CoA thioesterase II  28.47 
 
 
285 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3037  acyl-CoA thioesterase II  30.35 
 
 
286 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.124499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3217  acyl-CoA thioesterase II  30.35 
 
 
286 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752316  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2791  acyl-CoA thioesterase II  31.92 
 
 
288 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000176702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2556  acyl-CoA thioesterase II  31.33 
 
 
287 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1443  palmitoyl-CoA hydrolase  31.39 
 
 
318 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2170  Palmitoyl-CoA hydrolase  31.69 
 
 
326 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118533 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0581  acyl-CoA thioesterase II  30.47 
 
 
286 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000605498  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0658  acyl-CoA thioesterase II  33.46 
 
 
289 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0141931  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11634  acyl-CoA thioesterase II tesB1  31.45 
 
 
300 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.186026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4660  acyl-CoA thioesterase II  32.17 
 
 
289 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4095  acyl-CoA thioesterase II  29.27 
 
 
294 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3049  acyl-CoA thioesterase II  30.34 
 
 
294 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3076  acyl-CoA thioesterase II  29.96 
 
 
286 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00416001  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0531  acyl-CoA thioesterase  31.16 
 
 
299 aa  123  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0268  acyl-CoA thioesterase II  29.18 
 
 
291 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0509074  normal  0.217482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3831  acyl-CoA thioesterase II  31.85 
 
 
282 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1694  acyl-CoA thioesterase II  30.77 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.71753  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3719  acyl-CoA thioesterase II  31.25 
 
 
289 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24660  acyl-CoA thioesterase  31.82 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606526  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1619  acyl-CoA thioesterase II  30.77 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1688  acyl-CoA thioesterase II  30.77 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.720856  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2210  acyl-CoA thioesterase II  31.71 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2961  acyl-CoA thioesterase II  30.8 
 
 
288 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.524198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1278  acyl-CoA thioesterase II  29.13 
 
 
289 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.456689  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3742  acyl-CoA thioesterase II  33.47 
 
 
294 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102004  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1540  acyl-CoA thioesterase II  30.8 
 
 
288 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.799607  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2836  acyl-CoA thioesterase II  30.8 
 
 
288 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3210  Choloyl-CoA hydrolase  32.37 
 
 
293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1064  palmitoyl-CoA hydrolase  30.88 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1834  acyl-CoA thioesterase II  32.85 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>