62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0934 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0934  hydrogenase expression/synthesis, HypA  100 
 
 		 111 aa  227  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1412  hydrogenase expression/synthesis, HypA  61.26 
 
 		 114 aa  154  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0480002  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1023  hydrogenase expression/synthesis, HypA  58.56 
 
 		 113 aa  146  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136662  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  59.82 
 
 		 114 aa  144  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0365  hypothetical protein  52.29 
 
 		 114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  30.53 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  35.4 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  31.58 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2334  hydrogenase expression/synthesis HypA  32.77 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  34.21 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1312  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.65 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2782  hydrogenase nickel insertion protein HypA  36.28 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0656  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.82 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0730  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.525466  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  33.33 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.82 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.7 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.7 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3880  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.58 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.451178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  34.51 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.407443  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3018  hydrogenase expression/synthesis, HypA  32.74 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1303  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.23 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.263812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3365  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.66 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0925  hydrogenase expression/synthesis, HypA  33.33 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.83 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3156  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.7 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0679  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.89 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  29.91 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.32 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  33.33 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1042  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.32 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.53 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  23.97 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0514  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.62 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0729285 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1173  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.22 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4512  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.3 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3220  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.97 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1088  hydrogenase nickel insertion protein HypA  33.05 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.909847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0476  hydrogenase formation/expression  30.7 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.653213  normal  0.217154 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0650  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.42 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.235635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1811  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.59 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2089  hydrogenase expression/formation protein HypA  26.96 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1373  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.42 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1942  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384246  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1517  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.36 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0160728  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1904  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.5 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0320929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0468  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.2 
 
 		 114 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.984402  normal  0.0359796 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1867  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.59 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2166  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.83 
 
 		 113 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.591448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.82 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.56 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1832  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.5 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.524005  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17140  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  27.35 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0851583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1879  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.64 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1565  hydrogenase expression/synthesis HypA  33.33 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1645  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.31 
 
 		 113 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.428632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2039  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.78 
 
 		 114 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>