More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1024 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
277 aa  554  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.62 
 
 
280 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.439013  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.53 
 
 
279 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.288274  normal  0.29741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.14 
 
 
266 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.64422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5231  short chain dehydrogenase  76 
 
 
252 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0476444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0215  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4340  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 
280 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0293254  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
278 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0130127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3000  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 
272 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0641388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
306 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.72 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.276621 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18450  short chain dehydrogenase  27.57 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0882393  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1001  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.903414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4241  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  33.67 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.73 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3782  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.92 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3786  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.92 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71727  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3855  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.92 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.420893  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2405  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.94 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  23.84 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  28.78 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  27.27 
 
 
255 aa  72  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.64 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  28.41 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.4 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.45 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  29.04 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  29.04 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  29.04 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  28.32 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.81 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.54 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2375  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.91 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138252  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1668  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.554657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.21 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.1 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.41 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.21 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5935  FixR protein  27.96 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.1 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  26.33 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  29.45 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.19 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3499  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.330671  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7117  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.69 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.76 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.27 
 
 
247 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.21 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.5 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.56 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  30.32 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.09 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0860852  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.83 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.113929  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35072  normal  0.362703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  28.06 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.72 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28 
 
 
266 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.62 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  27.44 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 
247 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0814421  hitchhiker  0.00152828 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.94 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  26.13 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3909  hypothetical protein  27.18 
 
 
248 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.81 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.09 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7132  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.928828  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.41 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  24.91 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  26.26 
 
 
248 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0018  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  26.2 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.44 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.82 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.82 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.94 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2450  3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.59 
 
 
257 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0588797  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.68 
 
 
246 aa  63.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  30.11 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.91 
 
 
246 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>