More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl493 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl493  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.363056  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0663  50S ribosomal protein L13  76.16 
 
 		 151 aa  246  7e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.131584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 145 aa  167  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 145 aa  159  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  53.57 
 
 		 145 aa  157  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  52.86 
 
 		 145 aa  156  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  50.36 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  51.08 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  51.06 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  48.34 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 		 148 aa  149  8e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0628  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0115715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  47.1 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0434  50S ribosomal protein L13  51.56 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0288817  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 151 aa  147  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  48.25 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  51.08 
 
 		 147 aa  146  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  49.26 
 
 		 142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  51.88 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  48.25 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  48.23 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  47.52 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  43.36 
 
 		 149 aa  143  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  48.46 
 
 		 142 aa  144  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  46.92 
 
 		 142 aa  143  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  43.36 
 
 		 149 aa  143  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  45.8 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  45.39 
 
 		 143 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  47.41 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  47.69 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  49.62 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  45.8 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  47.33 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  45.45 
 
 		 150 aa  141  2e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  46.36 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  44.6 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  46.36 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  46.97 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  45.45 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  46.81 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  46.92 
 
 		 142 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  45.45 
 
 		 142 aa  140  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  46.92 
 
 		 142 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  46.92 
 
 		 142 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  45.32 
 
 		 142 aa  141  4e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  47.69 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  46.15 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  46.21 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  50.75 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  46.92 
 
 		 142 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  46.92 
 
 		 142 aa  140  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  46.92 
 
 		 142 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  46.92 
 
 		 142 aa  140  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3372  50S ribosomal protein L13  46.21 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3454  50S ribosomal protein L13  46.21 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3518  50S ribosomal protein L13  46.21 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  45.38 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  46.56 
 
 		 142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  45.45 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  44.68 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  46.1 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  47.06 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  39.86 
 
 		 163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  44.06 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  44.6 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  45.39 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  44.29 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>