More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl129 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl129  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 241 aa  483  1e-135  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0690  30S ribosomal protein S3  75.1 
 
 		 233 aa  364  1e-100  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  54.98 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  54.98 
 
 		 218 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 226 aa  224  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  53.55 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  53.08 
 
 		 219 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  48.68 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  53.08 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  49.33 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  49.33 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  53.08 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  46.67 
 
 		 275 aa  215  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  48.88 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  48.6 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  50.71 
 
 		 217 aa  211  7e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  50.71 
 
 		 217 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  48.43 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1046  30S ribosomal protein S3  46.29 
 
 		 287 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  48.13 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1019  30S ribosomal protein S3  46.29 
 
 		 287 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  43.88 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1036  30S ribosomal protein S3  46.29 
 
 		 287 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  48.43 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  48.43 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  48.43 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  50.44 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  48.43 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  48.13 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  47.72 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  47.72 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  48.13 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5043  30S ribosomal protein S3  47 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.084323  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  48.13 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  47.72 
 
 		 233 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  47.72 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  48.82 
 
 		 214 aa  209  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  48.43 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  48.43 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  48.43 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  45.5 
 
 		 325 aa  208  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  49.05 
 
 		 288 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  49.29 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  46.78 
 
 		 230 aa  209  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf436  30S ribosomal protein S3  46.35 
 
 		 247 aa  208  6e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  47.3 
 
 		 233 aa  208  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  45.05 
 
 		 315 aa  207  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  42.34 
 
 		 282 aa  207  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  49.32 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0937  30S ribosomal protein S3  47.93 
 
 		 292 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  46.54 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  49.53 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  47.48 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  46.06 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  46.02 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1311  30S ribosomal protein S3  46.54 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3752  ribosomal protein S3  46.54 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  48.1 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  49.3 
 
 		 232 aa  204  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  47.39 
 
 		 395 aa  204  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  46.41 
 
 		 270 aa  204  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  44.58 
 
 		 232 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  46.54 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  45.74 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  48.82 
 
 		 221 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  45.65 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  47.98 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  47.98 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  44.17 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  47.98 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  49.54 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  49.3 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  48.36 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  43.64 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  46.7 
 
 		 227 aa  202  5e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>