More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl081 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl081  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 
151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.34874e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0025  single-strand DNA-binding protein  52.6 
 
 
146 aa  147  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  35.76 
 
 
150 aa  84  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  43.24 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  42.11 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  33.62 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  37.96 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  40 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  32.79 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  32.79 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  37.23 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  35.4 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  39.64 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  38.53 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  35.96 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  37.84 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  38.79 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  34.21 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  34.21 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  38.68 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  38.68 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  33.88 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  38.68 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  38.68 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  35.4 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  36.28 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  36.28 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  36.8 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  33.81 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  38.68 
 
 
167 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  39.62 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  39.62 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  38.68 
 
 
167 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  36.7 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  37.39 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  39.66 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  40.17 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  29.41 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  38.53 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  34.55 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  35.19 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  37.04 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  33.33 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  33.04 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  34.15 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  33.33 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  33.06 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  36.79 
 
 
224 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  39.09 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  36.59 
 
 
188 aa  63.9  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  34.55 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  35 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  32.08 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  34.15 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf695  single-stranded DNA-binding protein  32.39 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  32.87 
 
 
168 aa  62  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4211  single-strand binding protein  38.46 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040739  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  27.4 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  34.86 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  32.74 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  32.74 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  32.74 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  34.55 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  32.74 
 
 
160 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  30.48 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  32.41 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  31.86 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  37.04 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  36.45 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  34.86 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1921  single-strand DNA binding protein  32.71 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.827601  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  31.71 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  33.64 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1639  single-strand binding protein family  31.78 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.439521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  36 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  28.97 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  28.48 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  28.57 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  36.21 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  33.01 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  34.29 
 
 
186 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1703  single-stranded DNA-binding protein family  26.02 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350583  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  35.85 
 
 
174 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  30.25 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  29.41 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  35.04 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  33.64 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>