More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1703 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1703  single-stranded DNA-binding protein family  100 
 
 		 131 aa  271  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350583  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2171  single-strand binding protein  73.28 
 
 		 131 aa  200  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00228216  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2133  single-strand binding protein  73.28 
 
 		 131 aa  200  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000570292  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  38.39 
 
 		 138 aa  92  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  38.32 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  37.86 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  31.82 
 
 		 173 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  31.82 
 
 		 173 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  31.82 
 
 		 173 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  31.82 
 
 		 173 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  31.82 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  31.82 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  31.06 
 
 		 173 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  33.94 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  33.94 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  31.3 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  33.94 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  31.3 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  33.03 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  31.3 
 
 		 169 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  29.1 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  30.53 
 
 		 172 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 172 aa  84  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  33.94 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  33.94 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  32.73 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  33.03 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  33.96 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  30.33 
 
 		 185 aa  80.1  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  31.93 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  33.03 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  32.04 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  32.11 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  31.43 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  31.43 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  34.95 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  27.56 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  30.23 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  30.23 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  27.56 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  29.57 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  30.28 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  32.54 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  26.43 
 
 		 156 aa  67  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  27.2 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  27.2 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  27.2 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  30.63 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  26.98 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  26.83 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  35.58 
 
 		 175 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  29.06 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  34.29 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  28.7 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  25.2 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  28.69 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  27.72 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  25.37 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  30.89 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  26.85 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4276  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.7148099999999997e-20  normal  0.751726 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0025  single-strand DNA-binding protein  28.99 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  26.98 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  27.91 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2263  single-strand binding protein  30.56 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000257141  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  25.38 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  26.98 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  26.85 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  30.84 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  29.27 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  28.95 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6500  single-strand binding protein  28.85 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  29.06 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6592  single-strand binding protein  28.85 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130329  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  23.13 
 
 		 139 aa  57  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  32.67 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  32.67 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>