More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf695 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf695  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 
151 aa  311  9.999999999999999e-85  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  36.29 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  36.29 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  37.38 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  37.29 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  37.29 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  37.29 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  37.29 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  37.29 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  37.29 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  37.29 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  37.29 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  37.29 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  37.29 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  37.29 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  36.97 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  37.61 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  39.05 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  37.61 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  37.61 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  37.61 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  37.61 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  39.05 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  34.62 
 
 
119 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  35.29 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  35.24 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  30.6 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  41.77 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  41.77 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  34.93 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  41.77 
 
 
111 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  31.82 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  33.96 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  34.21 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  33.04 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  40.51 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  33.64 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  36.45 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  37.27 
 
 
131 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  33.94 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  32.82 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  39.74 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  39.74 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  39.74 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  39.74 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  28.78 
 
 
187 aa  67  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  34.26 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  33.01 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  26.9 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  39.74 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  30.3 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  32.17 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  32.8 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  33.04 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  29.82 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  37.66 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  37.66 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  32.38 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl081  single-stranded DNA-binding protein  32.39 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.34874e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  35.24 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  40.26 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  35.24 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  27.52 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  33.64 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  31.2 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  30.43 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  35.96 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  37.5 
 
 
150 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  37.5 
 
 
150 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  30.77 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  38.24 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  32.11 
 
 
148 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  33.33 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  38.96 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  25.68 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  27.03 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  33.64 
 
 
171 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  32.11 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  31.19 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  32.71 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  29.63 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  29.17 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  31.78 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  30.91 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  30.91 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  33 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  29.6 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2448  single-strand binding protein  34.48 
 
 
156 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2133  single-strand binding protein  30 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000570292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  25.77 
 
 
176 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2171  single-strand binding protein  30 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00228216  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1869  single-strand binding protein  32.08 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  30.1 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  24.34 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  29.81 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  29.81 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  33.75 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>