181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4173 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4686  glycosyl transferase family 39  90.03 
 
 		 598 aa  905    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4542  glycosyl transferase family 39  97.34 
 
 		 602 aa  996    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0207348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4173  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 602 aa  1142    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6372  glycosyl transferase family protein  68.24 
 
 		 600 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2164  glycosyl transferase family protein  65.63 
 
 		 573 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5864  glycosyl transferase family protein  67.3 
 
 		 579 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0380825  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4551  glycosyl transferase family protein  47.1 
 
 		 577 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2076  glycosyl transferase family protein  44.71 
 
 		 580 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1533  glycosyl transferase family protein  44.1 
 
 		 584 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.030992  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2917  glycosyl transferase family protein  43.56 
 
 		 580 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2544  glycosyl transferase family protein  43.74 
 
 		 581 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.327974  normal  0.26724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3917  glycosyl transferase family protein 39  43.78 
 
 		 580 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2553  glycosyl transferase family protein  42.98 
 
 		 580 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2825  glycosyl transferase family 39  44.11 
 
 		 581 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1888  glycosyl transferase family 39  40.48 
 
 		 552 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0174434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0380  glycosyl transferase family protein  39.59 
 
 		 570 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0012  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 		 557 aa  255  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1482  glycosyl transferase family protein  34.61 
 
 		 547 aa  248  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4522  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 		 568 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185613  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2389  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 		 637 aa  208  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  30.69 
 
 		 605 aa  127  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 		 631 aa  114  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  29.45 
 
 		 553 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  28.37 
 
 		 606 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  25.31 
 
 		 611 aa  101  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  29.79 
 
 		 528 aa  100  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  30.03 
 
 		 527 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 		 666 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 		 553 aa  96.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  29.75 
 
 		 575 aa  95.5  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  26.91 
 
 		 525 aa  92  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 547 aa  90.5  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  28.32 
 
 		 514 aa  90.1  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  25.96 
 
 		 519 aa  87.4  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  25.12 
 
 		 601 aa  87.4  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  26.2 
 
 		 520 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 514 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  25.55 
 
 		 601 aa  84.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  24.8 
 
 		 612 aa  84  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  25.84 
 
 		 516 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  27.58 
 
 		 622 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  27.58 
 
 		 622 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  26.87 
 
 		 596 aa  82.8  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  25.91 
 
 		 515 aa  82.8  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  25.27 
 
 		 612 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  28.66 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  28.66 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  24.07 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  25.81 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  25.33 
 
 		 604 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.59 
 
 		 601 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 557 aa  77  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  22.52 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  27.6 
 
 		 515 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.59 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2663  glycosyl transferase family protein  24.05 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202263  normal  0.576017 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.37 
 
 		 552 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  26.36 
 
 		 563 aa  68.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.45 
 
 		 556 aa  67.4  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  24.08 
 
 		 323 aa  67  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.89 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  26.81 
 
 		 578 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06171  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.74 
 
 		 613 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0423817 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  26.89 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  26.35 
 
 		 585 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 564 aa  63.5  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.49 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  23.36 
 
 		 565 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5158  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636503  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.49 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  23.78 
 
 		 512 aa  62  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0809  hypothetical protein  27.65 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0928  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 		 600 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0620679  normal  0.549908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3674  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 585 aa  60.5  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1445  glycosyl transferase family 39  26.1 
 
 		 599 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1388  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.81 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.06 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.65 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1767  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224436  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03391  glycosyl transferase, family 39  24.55 
 
 		 600 aa  59.3  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1878  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.81 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0019  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.81 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2273  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.81 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1150  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.81 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.27 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1416  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13829  normal  0.139268 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.27 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1409  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  26.02 
 
 		 556 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5631  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  28.48 
 
 		 803 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1297  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.59 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2399  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.51 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2235  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.3 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  25.59 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.59 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>