156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2164 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2164  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
573 aa  1087    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13008  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4686  glycosyl transferase family 39  65.37 
 
 
598 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4173  glycosyl transferase family protein  65.31 
 
 
602 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4542  glycosyl transferase family 39  65.66 
 
 
602 aa  561  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0207348  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6372  glycosyl transferase family protein  66.24 
 
 
600 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5864  glycosyl transferase family protein  62.99 
 
 
579 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0380825  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4551  glycosyl transferase family protein  47.67 
 
 
577 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2917  glycosyl transferase family protein  44.39 
 
 
580 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1533  glycosyl transferase family protein  44.54 
 
 
584 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.030992  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2076  glycosyl transferase family protein  44.09 
 
 
580 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3917  glycosyl transferase family protein 39  44.95 
 
 
580 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2553  glycosyl transferase family protein  44.31 
 
 
580 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2544  glycosyl transferase family protein  44.25 
 
 
581 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.327974  normal  0.26724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2825  glycosyl transferase family 39  43.96 
 
 
581 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1888  glycosyl transferase family 39  36.9 
 
 
552 aa  287  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0174434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0380  glycosyl transferase family protein  38.17 
 
 
570 aa  260  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4522  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 
568 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185613  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1482  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 
547 aa  229  8e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0012  glycosyl transferase family protein  42.54 
 
 
557 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2389  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
637 aa  206  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  26.2 
 
 
605 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  27.54 
 
 
553 aa  97.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  32.09 
 
 
527 aa  97.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 
547 aa  96.7  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  26.01 
 
 
611 aa  95.1  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  28.53 
 
 
528 aa  94  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  29.41 
 
 
514 aa  90.5  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
666 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 
631 aa  87.4  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
553 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  27.45 
 
 
516 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  26.75 
 
 
575 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  26.89 
 
 
520 aa  80.9  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
514 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  28.21 
 
 
596 aa  79.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  22.38 
 
 
601 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.05 
 
 
554 aa  77  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.05 
 
 
554 aa  77  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.05 
 
 
554 aa  77  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  23.35 
 
 
601 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  24.06 
 
 
612 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  27.86 
 
 
552 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
554 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.08 
 
 
556 aa  74.3  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  26.61 
 
 
515 aa  74.3  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  26.47 
 
 
525 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  25.83 
 
 
519 aa  73.2  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 
573 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  26.86 
 
 
556 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.86 
 
 
556 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2845  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.24 
 
 
549 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108671  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  24.74 
 
 
622 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
557 aa  70.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  24.74 
 
 
622 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  28.2 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  23.54 
 
 
612 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  24.61 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0287  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
515 aa  68.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  24.57 
 
 
604 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  29.4 
 
 
586 aa  67.8  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  24.68 
 
 
563 aa  64.7  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.86 
 
 
555 aa  64.7  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3623  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
603 aa  64.7  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000798487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  26.65 
 
 
606 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 
550 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  25 
 
 
550 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  25 
 
 
550 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.82 
 
 
553 aa  63.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 
550 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  26.03 
 
 
537 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  21.88 
 
 
601 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  21.89 
 
 
609 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.07 
 
 
550 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.73 
 
 
550 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0714  hypothetical protein  28.57 
 
 
464 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0157083 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.27 
 
 
550 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 
550 aa  62.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4019  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  28.19 
 
 
550 aa  62  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.73 
 
 
550 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  25.25 
 
 
323 aa  61.6  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  22.15 
 
 
534 aa  61.6  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  25.39 
 
 
564 aa  60.8  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0648  family 39 glycosyl transferase  23.84 
 
 
515 aa  60.5  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  27.86 
 
 
541 aa  60.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
557 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  28.86 
 
 
575 aa  59.7  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0137  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.75 
 
 
478 aa  58.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234372  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0126  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.75 
 
 
477 aa  58.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3370  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
582 aa  58.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0479028  normal  0.0785337 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0809  hypothetical protein  30.73 
 
 
580 aa  57.8  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  26.94 
 
 
563 aa  57.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.94 
 
 
563 aa  57.8  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  25.45 
 
 
578 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1297  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
515 aa  57.4  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.370889  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  26.69 
 
 
556 aa  57.4  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4820  glycosyl transferase family 39  25.47 
 
 
528 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5631  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferase of PMT family-like protein  28.11 
 
 
803 aa  57  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.669475 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1790  glycosyl transferase family 39  24.73 
 
 
565 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0176335  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2195  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  26.03 
 
 
601 aa  56.2  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000970207  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1803  glycosyl transferase family 39  25 
 
 
585 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00158078 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>