More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3856 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2878  acriflavin resistance protein  68.32 
 
 		 1070 aa  1528    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.304321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4312  acriflavin resistance protein  46.94 
 
 		 1055 aa  928    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0578922  normal  0.332205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0178  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.71 
 
 		 1056 aa  798    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6522  acriflavin resistance protein  45.97 
 
 		 1078 aa  917    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658721  normal  0.0251174 
 
 
-
 
NC_003296  RS02154  transport transmembrane protein  46.36 
 
 		 1064 aa  918    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5876  acriflavin resistance protein  44.91 
 
 		 1082 aa  912    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5740  acriflavin resistance protein  45.72 
 
 		 1076 aa  915    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4896  acriflavin resistance protein  46.66 
 
 		 1068 aa  936    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.428837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1966  acriflavin resistance protein  45.48 
 
 		 1072 aa  877    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.94 
 
 		 1462 aa  827    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3224  acriflavin resistance protein  46.89 
 
 		 1055 aa  941    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3856  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1076 aa  2174    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.112482 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0077  hypothetical protein  43.94 
 
 		 1058 aa  876    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5202  acriflavin resistance protein  46.57 
 
 		 1084 aa  934    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.842628  normal  0.949774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0122  acriflavin resistance protein  38.21 
 
 		 1122 aa  731    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.266494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1437  acriflavin resistance protein  44.61 
 
 		 1064 aa  858    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.409748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1816  acriflavin resistance protein  46.44 
 
 		 1072 aa  896    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0132878  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1277  acriflavin resistance protein  36.27 
 
 		 1109 aa  658    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1726  acriflavin resistance protein  47.08 
 
 		 1055 aa  938    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0296271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3819  acriflavin resistance protein  46.66 
 
 		 1068 aa  936    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4538  acriflavin resistance protein  79.37 
 
 		 1090 aa  1719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2716  acriflavin resistance protein  38.89 
 
 		 1057 aa  732    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.222625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2444  acriflavin resistance protein  54.75 
 
 		 1073 aa  1113    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.011733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3609  acriflavin resistance protein  43.95 
 
 		 1064 aa  871    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.810117  normal  0.320832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4615  acriflavin resistance protein  43.93 
 
 		 1061 aa  836    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3360  cation efflux transporter  44.91 
 
 		 1061 aa  889    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4362  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  45.22 
 
 		 1060 aa  910    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1393  cation efflux transporter  46.52 
 
 		 1081 aa  924    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.264044  normal  0.0907151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2072  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  45.53 
 
 		 1082 aa  919    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.739082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1140  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  43.7 
 
 		 1063 aa  868    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.359537 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6992  acriflavin resistance protein  44.98 
 
 		 1082 aa  889    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166415 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0568  acriflavin resistance protein  42.9 
 
 		 1065 aa  792    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0226  acriflavin resistance protein  70.38 
 
 		 1087 aa  1518    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.959643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4315  acriflavin resistance protein  96.3 
 
 		 1080 aa  2074    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.676925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1750  acriflavin resistance protein  44.79 
 
 		 1065 aa  877    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122403 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1954  acriflavin resistance protein  43.63 
 
 		 1064 aa  857    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2553  acriflavin resistance protein  50 
 
 		 1072 aa  990    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1501  acriflavin resistance protein  45.17 
 
 		 1082 aa  879    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157071  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3751  acriflavin resistance protein  44.49 
 
 		 1084 aa  895    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4073  acriflavin resistance protein  46.8 
 
 		 1055 aa  938    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435843  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  47.08 
 
 		 1055 aa  931    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5200  acriflavin resistance protein  49.81 
 
 		 1052 aa  994    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5687  acriflavin resistance protein  44.49 
 
 		 1084 aa  895    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117283 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2952  acriflavin resistance protein  41.02 
 
 		 1057 aa  788    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.477034  normal  0.0644125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4650  acriflavin resistance protein  45.37 
 
 		 1064 aa  871    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.763131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7212  acriflavin resistance protein  45.62 
 
 		 1065 aa  907    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.407199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4165  acriflavin resistance protein  99.63 
 
 		 1076 aa  2169    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.352988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2096  acriflavin resistance protein  45.57 
 
 		 1072 aa  875    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3711  acriflavin resistance protein  47.18 
 
 		 1055 aa  934    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5984  acriflavin resistance protein  45.47 
 
 		 1076 aa  915    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.026118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2848  acriflavin resistance protein  43.85 
 
 		 1057 aa  863    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0271667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0360  acriflavin resistance protein  44.85 
 
 		 1060 aa  903    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4293  acriflavin resistance protein  46.8 
 
 		 1055 aa  938    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4617  acriflavin resistance protein  44.49 
 
 		 1084 aa  895    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406351  normal  0.0806311 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6328  acriflavin resistance protein  45.17 
 
 		 1082 aa  879    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0756078  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  33.09 
 
 		 1044 aa  588  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1722  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.77 
 
 		 1049 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4285  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 		 1095 aa  552  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0461  acriflavin resistance protein  33.83 
 
 		 1075 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1160  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1086 aa  546  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.561236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4013  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 		 1052 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00812103  normal  0.0431694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0256  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 		 1104 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543076  normal  0.0161956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3160  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.74 
 
 		 1460 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2616  acriflavin resistance protein  32.47 
 
 		 1087 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0710341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2583  acriflavin resistance protein  32.19 
 
 		 1072 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000643867  normal  0.0481028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1043 aa  406  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 		 1034 aa  403  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.22 
 
 		 1050 aa  382  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 		 1041 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.25 
 
 		 1024 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 		 1032 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  29.63 
 
 		 1069 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.28 
 
 		 1496 aa  363  8e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1053 aa  360  6e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.51 
 
 		 1039 aa  358  3.9999999999999996e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1067 aa  357  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 		 1055 aa  353  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1039 aa  353  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  30.18 
 
 		 1054 aa  352  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1054 aa  352  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1036 aa  350  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1054 aa  350  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1071 aa  349  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1095 aa  349  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1058 aa  348  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1046 aa  348  4e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1075 aa  348  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1051 aa  346  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.07 
 
 		 1034 aa  345  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1024 aa  345  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.35 
 
 		 1034 aa  342  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1066 aa  342  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 		 1070 aa  340  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.82 
 
 		 1049 aa  340  8e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1038 aa  340  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.24 
 
 		 1036 aa  340  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 1044 aa  339  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1048 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 		 1049 aa  338  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1040 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>