More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0793 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  100 
 
 
569 aa  1174    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  90.69 
 
 
569 aa  1057    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  78.62 
 
 
556 aa  893    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  74.28 
 
 
556 aa  795    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  78.2 
 
 
590 aa  855    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  72.45 
 
 
561 aa  806    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  71.66 
 
 
561 aa  798    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  77.26 
 
 
555 aa  879    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  79.06 
 
 
554 aa  894    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  35.69 
 
 
524 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  35.44 
 
 
526 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  32.3 
 
 
546 aa  252  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  35.91 
 
 
510 aa  251  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  34.29 
 
 
564 aa  249  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  35.6 
 
 
515 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  33.21 
 
 
508 aa  247  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  33.33 
 
 
513 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  33.33 
 
 
521 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  35.26 
 
 
554 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  31.52 
 
 
547 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  33.6 
 
 
557 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  33.33 
 
 
545 aa  236  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  34.81 
 
 
502 aa  235  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  34.94 
 
 
508 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  33.47 
 
 
552 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  33.21 
 
 
505 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  33.8 
 
 
522 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  31.44 
 
 
512 aa  227  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  33.4 
 
 
496 aa  227  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  34.06 
 
 
496 aa  226  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  33.13 
 
 
544 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  33.01 
 
 
505 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  32.4 
 
 
555 aa  226  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  32.84 
 
 
542 aa  225  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  32.54 
 
 
522 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  33.13 
 
 
567 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  30.65 
 
 
514 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  30.65 
 
 
514 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  32.14 
 
 
579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  31.58 
 
 
552 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  32.77 
 
 
525 aa  216  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  33.47 
 
 
560 aa  216  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  31.38 
 
 
549 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  33.06 
 
 
522 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  29.94 
 
 
505 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  30.78 
 
 
470 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  31.85 
 
 
512 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  31.12 
 
 
548 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  30.36 
 
 
517 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  30.04 
 
 
440 aa  203  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  30.48 
 
 
512 aa  200  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  32.52 
 
 
466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  29.81 
 
 
533 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.52 
 
 
480 aa  192  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  30.3 
 
 
550 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  32.84 
 
 
462 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  29.17 
 
 
486 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  32.52 
 
 
496 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  30.21 
 
 
525 aa  180  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  29 
 
 
452 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  30.88 
 
 
551 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  30.88 
 
 
551 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  30.88 
 
 
551 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  31.27 
 
 
551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  30.88 
 
 
551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  32.51 
 
 
543 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  29.87 
 
 
497 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  31.22 
 
 
497 aa  170  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  31.03 
 
 
520 aa  168  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  28.75 
 
 
471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  32.94 
 
 
458 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  30.57 
 
 
500 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  28.72 
 
 
497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  28.9 
 
 
497 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  28.9 
 
 
497 aa  163  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  31.13 
 
 
506 aa  164  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  31.42 
 
 
523 aa  163  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  28.9 
 
 
497 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  31.53 
 
 
487 aa  160  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  29.3 
 
 
553 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3047  sulfatase  28.99 
 
 
503 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0209579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  30 
 
 
523 aa  160  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  27.74 
 
 
526 aa  159  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  29.37 
 
 
440 aa  158  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.02 
 
 
501 aa  157  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  27.29 
 
 
495 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  29.7 
 
 
548 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  29.56 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  29.65 
 
 
491 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  28.68 
 
 
506 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  29.24 
 
 
468 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  30.11 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  31.25 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  29.62 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  29.26 
 
 
482 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  27.99 
 
 
453 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  30.38 
 
 
474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  26.72 
 
 
465 aa  146  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  28.16 
 
 
490 aa  146  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2849  sulfatase  28.2 
 
 
503 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000585259  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>