More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0478 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  100 
 
 		 205 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  51.32 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  42.31 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  40.83 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 139 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 141 aa  74.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  49.28 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 146 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  50 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  38.17 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 146 aa  72  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 136 aa  72  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  38.79 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  41.88 
 
 		 141 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  33.79 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.12 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  34.81 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3797  transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  33.57 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 140 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 146 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 143 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  45.71 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  45.71 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3502  transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.733746 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  45.71 
 
 		 151 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 162 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  45.71 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  46.38 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  44.29 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  44.93 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  36.45 
 
 		 135 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  41.67 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 143 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 144 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 137 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 131 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 143 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  37.96 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  47.83 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.96 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  43.66 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  44.29 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  44.29 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  44.29 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  44.29 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  44.29 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>