More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2212 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2212  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  243  8e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1570  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3374  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3676  response regulator receiver  40.17 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.284761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1819  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1693  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 121 aa  95.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4245  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 121 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3918  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.734494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6557  chemotaxis protein cheY  39.32 
 
 		 121 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.803572  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0522  CheY protein  39.32 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.757769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4836  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.0072817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4033  response regulator receiver protein  43.81 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102003  normal  0.596674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0526  chemotaxis protein cheY  36.75 
 
 		 129 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0660  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.711341 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1712  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.599884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1531  response regulator receiver  41.12 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0584637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1811  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000108366  normal  0.182528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3337  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3080  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.425562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0067  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0522  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0096  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1534  putative chemotaxis protein cheY  30.09 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.358935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1910  response regulator receiver  33.33 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0109911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3528  two component response regulator  33.91 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2607  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1527  response regulator receiver protein, CheY  33.04 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.439374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  33.05 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  35.59 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1722  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  33.33 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  33.61 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  35.59 
 
 		 121 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0180  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0905  response regulator receiver protein  33.02 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000245258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 1066 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  36.28 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  29.51 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0256  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  35 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  31.67 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0740  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.748178  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2561  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0843  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 251 aa  63.5  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000594696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  33.93 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0386  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2150  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0332475  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.91 
 
 		 1442 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0263  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.419062 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.4 
 
 		 841 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  30.83 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  32.74 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  31.13 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  30.58 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2284  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.24 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  31.67 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  33.93 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3857  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.161717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1888  response regulator receiver protein  30.19 
 
 		 365 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.660438  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2339  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 231 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>