More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2078 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 248 aa  474  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.11 
 
 		 266 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.506862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2598  ABC transporter, inner membrane subunit  62.67 
 
 		 266 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.541823  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.04 
 
 		 266 aa  211  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  0.383291 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.605397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 		 268 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  0.644528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1369  ABC transporter membrane protein  33.64 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.64 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0649738  hitchhiker  0.00238236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 		 285 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.753313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.02 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2583  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.338733  normal  0.193625 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696299  normal  0.124912 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.78 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  31.46 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  31.69 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  31.69 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  31.69 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 		 281 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 		 315 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.208956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.82 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  31.28 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  31.28 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  34.85 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.85 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.64 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2837  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.56 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.115716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  34.02 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 		 274 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8275  ABC-type transporter, permease protein  30.09 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.05 
 
 		 277 aa  101  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  30.86 
 
 		 275 aa  101  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  30.86 
 
 		 275 aa  101  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4332  ABC transporter permease  30.26 
 
 		 298 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7502  ABC transporter permease  33.48 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.50681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.14 
 
 		 279 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00650739  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1692  putative ABC transporter membrane protein  32.84 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2358  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  30.58 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.616361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  33.04 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1129  taurine transport system permease protein TauC  27.62 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.774255  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 		 283 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189471  normal  0.0804385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1867  ABC transporter permease  33.2 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  31.28 
 
 		 275 aa  99  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.11 
 
 		 279 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.06 
 
 		 298 aa  99  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.30367  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 		 264 aa  98.6  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  33.03 
 
 		 264 aa  98.6  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 		 283 aa  98.6  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  hitchhiker  0.00000636426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 		 286 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 		 279 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3599  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 		 292 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.91 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 		 283 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199649  normal  0.0607956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0101223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4139  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.74 
 
 		 275 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314222  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 		 283 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>