51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3472 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3472  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  268  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2838  quinoprotein glucose dehydrogenase  53.92 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 		 415 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 		 415 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  36.84 
 
 		 678 aa  75.5  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  36.79 
 
 		 401 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3640  cytochrome c class I  35.87 
 
 		 417 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102782  normal  0.70332 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  37.86 
 
 		 412 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  39.25 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0307  putative cytochrome c  34.65 
 
 		 410 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0124667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  35.58 
 
 		 409 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  35 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  32.22 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  36.9 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  37.31 
 
 		 708 aa  50.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  32.08 
 
 		 195 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  27.1 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  27.1 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  26.42 
 
 		 327 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  28.28 
 
 		 568 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  28.28 
 
 		 568 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 304 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  31.52 
 
 		 315 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1402  hypothetical protein  32.79 
 
 		 170 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.781476  normal  0.402158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  31.78 
 
 		 382 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  28.74 
 
 		 209 aa  43.9  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  27.78 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  26.19 
 
 		 327 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  29.25 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 304 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  36.71 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  32.95 
 
 		 291 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  32.95 
 
 		 293 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  36.71 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  28 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  35.23 
 
 		 251 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  35.44 
 
 		 671 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  25.71 
 
 		 187 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  28 
 
 		 272 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  27.36 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  29.55 
 
 		 271 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  30.86 
 
 		 310 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3125  hydroxylamine reductase  27.1 
 
 		 574 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.74527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5010  hydroxylamine reductase  28.4 
 
 		 567 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  60.71 
 
 		 329 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  30 
 
 		 346 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 329 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>