257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1844 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1844  major facilitator transporter  100 
 
 		 389 aa  739    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  49.36 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2437  major facilitator superfamily MFS_1  46.67 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.905943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 382 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  32.98 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0670  ProP protein  31.05 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2924  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 388 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.755065  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2819  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0367  permease  29.4 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.32941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2676  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 396 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149282  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1617  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000010959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1226  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.184807  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4835  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3837  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  29.71 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  29.71 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  29.71 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3431  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00698685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  29.71 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  28.91 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  29.71 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 422 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1116  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  29.16 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  29.44 
 
 		 403 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  28.65 
 
 		 403 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  29.71 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  29.44 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  31.58 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  30.17 
 
 		 420 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1146  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 406 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155488  unclonable  0.000000029988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  31.86 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0930  fosmidomycin resistance protein  30.17 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1849  fosmidomycin resistance protein  30.17 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1463  fosmidomycin resistance protein  30.17 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1672  fosmidomycin resistance protein  30.17 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1694  fosmidomycin resistance protein  30.17 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.511968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1977  fosmidomycin resistance protein, putative  31.09 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.85297  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1645  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.849012  hitchhiker  0.000565509 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0419  fosmidomycin resistance protein  30.45 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.423949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0744  fosmidomycin resistance protein  30.45 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.944019  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  32.14 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  26.78 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0994  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 392 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.198268  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1610  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1365  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.399503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  29.94 
 
 		 420 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  31.18 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  31.18 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  31.18 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0282  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0137  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0222229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1320  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  hitchhiker  0.000000456317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3923  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  30.9 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4797  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 421 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.292232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0600  fosmidomycin resistance protein  31.94 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0546  fosmidomycin resistance protein  31.94 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.268965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0539  fosmidomycin resistance protein  31.94 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0556  fosmidomycin resistance protein  31.94 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.809506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  31.18 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  31.18 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 413 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0541  fosmidomycin resistance protein  31.67 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.404971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4112  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0806371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  30.7 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  28.77 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1478  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2804  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0158758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>