263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0404 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  315  2e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  62.09 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  53.57 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  51.57 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  50.94 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  53.69 
 
 		 148 aa  134  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  56.94 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  54.03 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  53.23 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  50.81 
 
 		 162 aa  117  9e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  49.29 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  50.7 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  47.13 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  49.65 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  48.34 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  48.09 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  48.74 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  48.25 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  50.34 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  54.47 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  48.05 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  47.46 
 
 		 161 aa  87.4  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  55.07 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  41.61 
 
 		 163 aa  84.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.07 
 
 		 165 aa  84.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  41.61 
 
 		 163 aa  84.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  45.08 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  42.38 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  42.52 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  41.94 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  38.33 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.9 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  43.7 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  43.7 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  44.44 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  46.22 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  46.22 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  46.22 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  41.43 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  47.73 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  50.7 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  38.14 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  44.54 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  39.45 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  32.16 
 
 		 207 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  37.61 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  40.43 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  35.78 
 
 		 240 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  37.5 
 
 		 317 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  43.7 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  43.7 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  43.7 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  43.7 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  37.5 
 
 		 317 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  36.67 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  32.64 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  36.89 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  36.52 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  36.22 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  35.83 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  32.65 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  36.67 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  37.76 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  31.67 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  34.65 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  39.8 
 
 		 262 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  37.23 
 
 		 216 aa  60.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  33.85 
 
 		 284 aa  60.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  35.2 
 
 		 218 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  37.96 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  36.73 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  38 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  40.74 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  40.74 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  40.74 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  40.74 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  36.36 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  32.84 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  40.74 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  35.04 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  36.36 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  40.74 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  38.32 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  36.36 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  40.74 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  33.64 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  35.35 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  36.84 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  32.17 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  50.55 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  32.17 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  35.83 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  35.35 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  35.35 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  38 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  35.35 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  38.38 
 
 		 289 aa  57.8  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  34.69 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  45 
 
 		 275 aa  57.4  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>