More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1373 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  99.65 
 
 
287 aa  590  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  81.53 
 
 
301 aa  497  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  75.26 
 
 
284 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  71.93 
 
 
289 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  70.03 
 
 
287 aa  418  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  67.94 
 
 
287 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  66.55 
 
 
287 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  62.72 
 
 
297 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  57.71 
 
 
299 aa  294  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  54.51 
 
 
297 aa  292  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  52.53 
 
 
285 aa  286  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  58.27 
 
 
291 aa  287  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  53.82 
 
 
299 aa  286  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  54.51 
 
 
301 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  54.55 
 
 
303 aa  281  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  54.12 
 
 
292 aa  281  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  54.72 
 
 
288 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  52.71 
 
 
279 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  54.18 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  53.94 
 
 
288 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  52.33 
 
 
276 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  52.33 
 
 
279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  52.87 
 
 
305 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  55.87 
 
 
268 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  55.47 
 
 
268 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  54.84 
 
 
274 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  49.03 
 
 
292 aa  262  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  48.68 
 
 
288 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  49.81 
 
 
272 aa  257  2e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  51.57 
 
 
285 aa  255  7e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  50 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  50.75 
 
 
299 aa  249  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  51.38 
 
 
302 aa  248  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  52.14 
 
 
283 aa  248  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  46.3 
 
 
304 aa  248  8e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  49.43 
 
 
318 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  50 
 
 
279 aa  244  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  45.66 
 
 
294 aa  244  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  43.17 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  45.83 
 
 
291 aa  241  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  44.57 
 
 
270 aa  241  7.999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  46.95 
 
 
282 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  49.04 
 
 
315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  49.04 
 
 
292 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  49.04 
 
 
292 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  48.66 
 
 
319 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  48.66 
 
 
319 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  48.66 
 
 
319 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.66 
 
 
282 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  46.69 
 
 
261 aa  235  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  50.62 
 
 
282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  43.98 
 
 
275 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  48.41 
 
 
271 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  47.24 
 
 
273 aa  228  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  45.67 
 
 
342 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  44.88 
 
 
276 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  46.3 
 
 
318 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  45.9 
 
 
342 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  45.45 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  46.4 
 
 
251 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  53.76 
 
 
175 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  56.72 
 
 
147 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  46.67 
 
 
247 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  44.44 
 
 
317 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  43.89 
 
 
317 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  45 
 
 
252 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  45 
 
 
252 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  45 
 
 
247 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  45 
 
 
218 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  44.44 
 
 
252 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  46.37 
 
 
273 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  42.93 
 
 
245 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  43.89 
 
 
252 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  50.34 
 
 
249 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  50.34 
 
 
249 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  43.89 
 
 
252 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  43.89 
 
 
252 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  50.34 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  50.34 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  50.34 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  50.34 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  50.34 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  48 
 
 
247 aa  155  6e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  43.89 
 
 
317 aa  155  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  45.35 
 
 
252 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  43.89 
 
 
249 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  37.65 
 
 
262 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  50.64 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  44.44 
 
 
247 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  52.03 
 
 
229 aa  153  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  40.81 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  47.31 
 
 
263 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  43.33 
 
 
239 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  51.7 
 
 
241 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  45 
 
 
241 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  46.11 
 
 
249 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  42.78 
 
 
239 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  48.5 
 
 
244 aa  150  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  52.38 
 
 
241 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>