247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4213 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  82.95 
 
 
350 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  83.17 
 
 
360 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  70.36 
 
 
356 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4374  hypothetical protein  67.57 
 
 
362 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  69.43 
 
 
348 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5269  hypothetical protein  57.69 
 
 
365 aa  327  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191534  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  55.88 
 
 
346 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  55.65 
 
 
336 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4549  hypothetical protein  61.77 
 
 
373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0029  hypothetical protein  57.32 
 
 
312 aa  295  9e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  50.45 
 
 
339 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  50.16 
 
 
341 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1346  hypothetical protein  46.35 
 
 
346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0950  hypothetical protein  53.06 
 
 
353 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  49.17 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  34.9 
 
 
340 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  33.54 
 
 
340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  33.77 
 
 
340 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  33.77 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  34.09 
 
 
352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  33.77 
 
 
340 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  33.44 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  33.44 
 
 
340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  34.9 
 
 
337 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  34.48 
 
 
340 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  34.74 
 
 
352 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  33.33 
 
 
355 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  34.91 
 
 
360 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  34.91 
 
 
360 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  34.18 
 
 
355 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  34.37 
 
 
348 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  33.1 
 
 
354 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  32.73 
 
 
339 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  32.82 
 
 
352 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  29.38 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  30.35 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  34.53 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0419  hypothetical protein  32.11 
 
 
346 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000120524  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  31.93 
 
 
355 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  30.5 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1827  conserved hypothetical protein 698  34.39 
 
 
346 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.811331  normal  0.978581 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  25.27 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  29.64 
 
 
328 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  34.83 
 
 
372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  29.56 
 
 
338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  32.03 
 
 
348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  30.63 
 
 
322 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  29.15 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  32.02 
 
 
380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  35.49 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  27.88 
 
 
335 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  30.72 
 
 
340 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  30.23 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  30 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  32.43 
 
 
361 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  30.96 
 
 
363 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  31.67 
 
 
359 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0806  hypothetical protein  32.32 
 
 
343 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0714883  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  34.91 
 
 
326 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  30.39 
 
 
348 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  27.05 
 
 
362 aa  106  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  30.69 
 
 
341 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4540  hypothetical protein  30.95 
 
 
342 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0584057  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  29.87 
 
 
349 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  30.84 
 
 
340 aa  104  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  30.53 
 
 
349 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 
349 aa  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  30.53 
 
 
349 aa  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  30.53 
 
 
349 aa  103  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  30.53 
 
 
349 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  30.53 
 
 
349 aa  103  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  30.53 
 
 
349 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  30.53 
 
 
349 aa  103  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  30.53 
 
 
349 aa  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  30.53 
 
 
349 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  30.53 
 
 
349 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  30.53 
 
 
349 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  30.38 
 
 
340 aa  103  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  30.53 
 
 
349 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  28.94 
 
 
368 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1009  hypothetical protein  35.29 
 
 
338 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1641  hypothetical protein  35.29 
 
 
338 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4276  hypothetical protein  35.29 
 
 
338 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.745778  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  31.87 
 
 
343 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  30.94 
 
 
325 aa  100  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  32.64 
 
 
347 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18100  predicted membrane protein  37.5 
 
 
361 aa  100  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  31.51 
 
 
355 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  31.85 
 
 
355 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  29.85 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  29.85 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6400  membrane protein-like protein  31.17 
 
 
472 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.798401  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  30.28 
 
 
362 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  29.51 
 
 
359 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  30.28 
 
 
362 aa  97.4  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  30.28 
 
 
362 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3881  hypothetical protein  36.22 
 
 
332 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8353  hypothetical protein  30.09 
 
 
346 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>