More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2542 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2542  protein of unknown function DUF37  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2267  hypothetical protein  97.17 
 
 		 106 aa  209  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.412253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2224  protein of unknown function DUF37  93.27 
 
 		 105 aa  201  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0489467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4641  hypothetical protein  81.9 
 
 		 110 aa  176  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7170  protein of unknown function DUF37  81.37 
 
 		 111 aa  173  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.536333  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6322  hypothetical protein  87.06 
 
 		 101 aa  157  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29696  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3875  hypothetical protein  59.41 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2181  hypothetical protein  56.12 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.209372  normal  0.016777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1654  hypothetical protein  56.12 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.341488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3251  hypothetical protein  57.29 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1326  hypothetical protein  56.57 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3117  hypothetical protein  60 
 
 		 109 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5187  hypothetical protein  56.47 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  62.82 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  62.82 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  60.26 
 
 		 119 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1006  hypothetical protein  66.22 
 
 		 108 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0642  hypothetical protein  56.63 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.485959  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1051  hypothetical protein  60.24 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1573  hypothetical protein  54.02 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0922315  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2047  hypothetical protein  57.14 
 
 		 134 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1847  hypothetical protein  58.24 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108627  normal  0.0267383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  57.65 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1652  hypothetical protein  50.53 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2209  hypothetical protein  54.88 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.304599  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  47.95 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  46.05 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  46.75 
 
 		 78 aa  73.9  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  44.94 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  44.74 
 
 		 76 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  44.87 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  48.57 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  46.48 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  50.82 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  52.46 
 
 		 89 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  46.27 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  44.74 
 
 		 76 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  50.82 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  50.82 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  50.82 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  50.82 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  50.82 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  50.82 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  52.38 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  49.18 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  49.18 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  47.76 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  47.76 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  49.18 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  47.54 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  47.54 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  47.54 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4526  hypothetical protein  46.88 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0565239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  44.93 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  47.14 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  47.54 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  44.29 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  47.14 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1842  hypothetical protein  41.67 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  47.14 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  50.82 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  38.36 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  52.46 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  49.21 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  54.1 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2140  hypothetical protein  50.79 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  46.38 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  45.16 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2394  hypothetical protein  45.57 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3616  hypothetical protein  53.33 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  48.39 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  42.03 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  49.18 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  47.54 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  43.48 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  34.18 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  45.12 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  43.48 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  45.21 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  47.54 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  46.27 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  42.67 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2036  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  41.1 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4507  hypothetical protein  43.66 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.89248 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  42.67 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  45.16 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  44.29 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  44.29 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  46.58 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  47.54 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  43.48 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  42.62 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3543  hypothetical protein  40.54 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  37.14 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  49.18 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  46.97 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  45.68 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>