37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0541 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0541  TadE family protein  100 
 
 		 191 aa  380  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  42.78 
 
 		 195 aa  161  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  40.64 
 
 		 202 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  41.21 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3897  TadE family protein  41.14 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  37.5 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  37.44 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  35.75 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  34.41 
 
 		 223 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  33.71 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  32.47 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  31.46 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  38.3 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  28.29 
 
 		 183 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  30.2 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  31.61 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  35.35 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  25.84 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  31.19 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  34.41 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  30.97 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  35.06 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  34.21 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  32.91 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  30.21 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  40 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  32.58 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  32.94 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  51.52 
 
 		 135 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0836  hypothetical protein  32.31 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.389481  normal  0.670982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  57.58 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  40.68 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  44.83 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  30.11 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  43.1 
 
 		 181 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  39.29 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  26.51 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>