34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1422 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  100 
 
 
172 aa  354  2.9999999999999997e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  72.83 
 
 
173 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  65.24 
 
 
170 aa  227  6e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  61.21 
 
 
173 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  59.17 
 
 
170 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  61.21 
 
 
166 aa  217  6e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  60.12 
 
 
170 aa  215  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  57.32 
 
 
248 aa  206  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  55.36 
 
 
171 aa  192  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  50.58 
 
 
173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  50.58 
 
 
173 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  50 
 
 
173 aa  186  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  51.74 
 
 
176 aa  184  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  50.58 
 
 
176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  50 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  50 
 
 
176 aa  182  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  49.43 
 
 
176 aa  179  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  47.67 
 
 
186 aa  177  9e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  48.28 
 
 
176 aa  176  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  43.79 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  42.6 
 
 
182 aa  137  7e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  42.6 
 
 
182 aa  134  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  41.57 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58071 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  40.24 
 
 
221 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  42.6 
 
 
182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  43.4 
 
 
169 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  41.42 
 
 
216 aa  130  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  39.88 
 
 
168 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  42.77 
 
 
226 aa  129  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  39.05 
 
 
220 aa  126  1.0000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  38.99 
 
 
178 aa  123  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  39.62 
 
 
217 aa  118  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  37.95 
 
 
175 aa  103  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0233  50S ribosomal protein L16  30.71 
 
 
138 aa  40.8  0.009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>