More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2189 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2189  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.292691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1835  dihydropteroate synthase  62.75 
 
 		 250 aa  328  7e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0743  dihydropteroate synthase  57.04 
 
 		 270 aa  318  5e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0021  dihydropteroate synthase  48.51 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1357  hypothetical protein  48.28 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00595472  hitchhiker  0.0000000289975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1815  dihydropteroate synthase  41.86 
 
 		 410 aa  201  8e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0448294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2314  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 		 408 aa  199  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1468  dihydropteroate synthase  37.26 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367897  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  33.08 
 
 		 397 aa  137  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0002  dihydropteroate synthase  32.08 
 
 		 427 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0616652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  33.98 
 
 		 407 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1844  dihydropteroate synthase  31.25 
 
 		 397 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1387  dihydropteroate synthase  31.05 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.398618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  34.43 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  32.23 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  33.85 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  34.55 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  37.11 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0060  dihydropteroate synthase  32.31 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.545012 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  32.97 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  34.31 
 
 		 270 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  32.31 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  34.51 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  32.31 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2646  Dihydropteroate synthase  30.91 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  32.31 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  32.31 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  34.11 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  37.01 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  37.3 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  32.95 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1570  dihydropteroate synthase  31.67 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  30.98 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  32.32 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  33.98 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  32.95 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  32.95 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  32.95 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  32.95 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  32.95 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  32.95 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  32.95 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 		 394 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  32.95 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  33.2 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2771  dihydropteroate synthase  30.99 
 
 		 391 aa  125  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00345874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0223  dihydropteroate synthase  32.05 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000034848  normal  0.0279297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  31.92 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 		 400 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  36.72 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1589  dihydropteroate synthase  32.61 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.864925 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  30.04 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  31.92 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  32.7 
 
 		 412 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  34.51 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  29.66 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  32.23 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  33.08 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  35.55 
 
 		 392 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  37.35 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  35.09 
 
 		 400 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  30.37 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  31.82 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  32.31 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  31.4 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3533  dihydropteroate synthase  35.94 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139072  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  33.85 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  32.68 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  30.15 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5465  dihydropteroate synthase  29.45 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  34.12 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0945  dihydropteroate synthase  31.3 
 
 		 279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  33.94 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  34.5 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  34.5 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11700  dihydropteroate synthase  33.58 
 
 		 283 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.407826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  31.92 
 
 		 277 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  32.94 
 
 		 283 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  32.05 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0499  dihydropteroate synthase  29.31 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.491755  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  30.42 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  30.42 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  31.66 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  30.42 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  30.65 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  30.89 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  32.06 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  30.77 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  28.68 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  30.63 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  31.94 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1969  dihydropteroate synthase  30.22 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000758372  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2317  dihydropteroate synthase  29.18 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.052999  normal  0.0227117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  33.08 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  35.18 
 
 		 437 aa  115  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>