More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1357 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1357  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  544  1e-154  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00595472  hitchhiker  0.0000000289975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0743  dihydropteroate synthase  51.94 
 
 
270 aa  266  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0021  dihydropteroate synthase  50 
 
 
267 aa  260  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1835  dihydropteroate synthase  49.6 
 
 
250 aa  250  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2189  dihydropteroate synthase  48.28 
 
 
270 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.292691  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1815  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
410 aa  202  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0448294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2314  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 
408 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1468  dihydropteroate synthase  35.66 
 
 
418 aa  150  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  38.06 
 
 
407 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  33.2 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  34.62 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  36.02 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2646  Dihydropteroate synthase  32.35 
 
 
291 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0002  dihydropteroate synthase  35.16 
 
 
427 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0616652  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1570  dihydropteroate synthase  30.4 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 
277 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  34.21 
 
 
278 aa  131  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  33.2 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  35.06 
 
 
397 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  35.41 
 
 
400 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  35.38 
 
 
282 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  36.08 
 
 
287 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  36.64 
 
 
290 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  35.66 
 
 
277 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1844  dihydropteroate synthase  34.43 
 
 
397 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  36.15 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  35.71 
 
 
376 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  36.15 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  36.15 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  36.15 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  36.15 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  36.15 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  34.88 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  33.58 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  33.09 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  35.38 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  34.23 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  34.48 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  35.91 
 
 
283 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  34.88 
 
 
278 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
277 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  35 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  33.08 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  33.85 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  37.84 
 
 
283 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  33.97 
 
 
277 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  35.77 
 
 
277 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  35.09 
 
 
277 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  34.59 
 
 
277 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  35.91 
 
 
283 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  33.85 
 
 
275 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  36.95 
 
 
269 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  34.62 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  33.71 
 
 
272 aa  125  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  36.95 
 
 
269 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  35.91 
 
 
283 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11700  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
283 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.407826  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 
280 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  33.09 
 
 
278 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  36.64 
 
 
289 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  34.62 
 
 
277 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  36.86 
 
 
394 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  33.85 
 
 
283 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  35.38 
 
 
277 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  35.52 
 
 
283 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  34.65 
 
 
347 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  35.38 
 
 
286 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  34.85 
 
 
275 aa  123  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  36.92 
 
 
278 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  33.08 
 
 
279 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  36.57 
 
 
412 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1387  dihydropteroate synthase  32.82 
 
 
405 aa  122  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.398618  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  33.2 
 
 
283 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  33.85 
 
 
286 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  37.35 
 
 
285 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  38.37 
 
 
284 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  33.97 
 
 
284 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  33.59 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  35.57 
 
 
393 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  33.59 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  35.89 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  34.87 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  37.21 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  32.82 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3166  dihydropteroate synthase  33.82 
 
 
418 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>