More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2833 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 282 aa  578  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  70.55 
 
 		 277 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  70.91 
 
 		 277 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  71.27 
 
 		 277 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  70.55 
 
 		 277 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  69.93 
 
 		 279 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  66.91 
 
 		 280 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  67.64 
 
 		 277 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  68.73 
 
 		 277 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  68 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  68.36 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  69.78 
 
 		 279 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  68.03 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  68 
 
 		 277 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  66.91 
 
 		 287 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  62.73 
 
 		 277 aa  359  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  61.4 
 
 		 282 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  61.4 
 
 		 282 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  61.4 
 
 		 282 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  61.4 
 
 		 282 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  61.4 
 
 		 282 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  61.4 
 
 		 282 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  61.4 
 
 		 282 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  61.4 
 
 		 282 aa  355  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  60.66 
 
 		 282 aa  355  5.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  61.03 
 
 		 282 aa  354  8.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  62.13 
 
 		 277 aa  354  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  62.98 
 
 		 277 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  62.98 
 
 		 277 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  61.48 
 
 		 277 aa  352  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  61.62 
 
 		 277 aa  352  4e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  62.45 
 
 		 282 aa  350  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  60.52 
 
 		 277 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  62.6 
 
 		 277 aa  348  5e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  60.29 
 
 		 282 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  60.29 
 
 		 282 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  60.29 
 
 		 282 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  60.29 
 
 		 282 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  59.06 
 
 		 277 aa  347  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  61.83 
 
 		 277 aa  344  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  59.93 
 
 		 282 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  60.46 
 
 		 286 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  59.16 
 
 		 274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  58.71 
 
 		 276 aa  326  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  58.52 
 
 		 278 aa  322  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  55.93 
 
 		 283 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  57.82 
 
 		 283 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  58.3 
 
 		 290 aa  314  9e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  53.93 
 
 		 283 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  57.09 
 
 		 283 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  55.19 
 
 		 283 aa  311  9e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  55.64 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  54.21 
 
 		 279 aa  310  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  56.36 
 
 		 283 aa  310  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  55.36 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  53.14 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  55 
 
 		 283 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  51.64 
 
 		 288 aa  305  7e-82  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  56.06 
 
 		 278 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  54.55 
 
 		 283 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  53.65 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  59.54 
 
 		 286 aa  296  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  55.34 
 
 		 276 aa  295  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  53.79 
 
 		 277 aa  295  8e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  52.5 
 
 		 283 aa  294  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  53.68 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42870  dihydropteroate synthase  54.55 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.307408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0982  dihydropteroate synthase  57.56 
 
 		 278 aa  279  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  54.38 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  51.34 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2876  dihydropteroate synthase  54.55 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0307138  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  51.34 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  51.15 
 
 		 275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  53.33 
 
 		 265 aa  266  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  52.42 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0536  dihydropteroate synthase  48.39 
 
 		 303 aa  265  5.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0325452  unclonable  0.00000000124281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  53.73 
 
 		 265 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  51.74 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  52.12 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2900  dihydropteroate synthase  56.36 
 
 		 277 aa  257  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1969  dihydropteroate synthase  47.57 
 
 		 285 aa  257  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000758372  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1974  dihydropteroate synthase  56.76 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490177 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1737  dihydropteroate synthase  45.02 
 
 		 298 aa  254  8e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.183796  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  52.42 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  49.09 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 299 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  48.75 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  52.03 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  50.73 
 
 		 280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  48.71 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2019  dihydropteroate synthase  43.34 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2618  dihydropteroate synthase  49.43 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.103274  normal  0.519468 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  49.46 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  49.46 
 
 		 296 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  50.95 
 
 		 275 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2625  dihydropteroate synthase  48.7 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  49.1 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  49.1 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  49.1 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>