More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0743 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0743  dihydropteroate synthase  100 
 
 
270 aa  545  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2189  dihydropteroate synthase  57.04 
 
 
270 aa  318  5e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.292691  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1835  dihydropteroate synthase  61.13 
 
 
250 aa  301  8.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0021  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 
267 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1357  hypothetical protein  51.94 
 
 
267 aa  266  2e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00595472  hitchhiker  0.0000000289975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1815  dihydropteroate synthase  42.25 
 
 
410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0448294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2314  dihydropteroate synthase  39.53 
 
 
408 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1468  dihydropteroate synthase  39.02 
 
 
418 aa  169  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367897  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  33.08 
 
 
397 aa  151  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  33.59 
 
 
266 aa  148  9e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  34.38 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  33.59 
 
 
275 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  34.5 
 
 
280 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  37.11 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1647  dihydropteroate synthase  31.64 
 
 
380 aa  139  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000944705  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1844  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
397 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  34.62 
 
 
277 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  34.32 
 
 
277 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  32.83 
 
 
400 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  33.58 
 
 
264 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  32.69 
 
 
277 aa  136  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  33.85 
 
 
277 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  32.69 
 
 
277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  32.31 
 
 
277 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  33.95 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  36.58 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  32.83 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  32.84 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  32.95 
 
 
277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  34.11 
 
 
279 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  32.97 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 
277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  34.35 
 
 
282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  35.36 
 
 
282 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  35.36 
 
 
282 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  35.36 
 
 
282 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  35.36 
 
 
282 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  35.36 
 
 
282 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  31.92 
 
 
277 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  35.36 
 
 
282 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  35.36 
 
 
282 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  35.36 
 
 
282 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  35.77 
 
 
394 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  36.72 
 
 
283 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1374  dihydropteroate synthase  32.17 
 
 
380 aa  132  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000647265  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0002  dihydropteroate synthase  31.94 
 
 
427 aa  132  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0616652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  35.36 
 
 
282 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
277 aa  131  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  33.97 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  35.57 
 
 
407 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  33.97 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  34.09 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  36.64 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  33.97 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  33.97 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  35.61 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  35.55 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 
283 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  32.71 
 
 
281 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  34.12 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  35.97 
 
 
286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  34.7 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  32.83 
 
 
283 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  35.97 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  32.14 
 
 
258 aa  129  7.000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2771  dihydropteroate synthase  32.28 
 
 
391 aa  128  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00345874  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  35.71 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  33.83 
 
 
277 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  32.95 
 
 
287 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  32.05 
 
 
274 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  34.51 
 
 
277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  33.59 
 
 
376 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0499  dihydropteroate synthase  33.58 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.491755  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2108  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  32.71 
 
 
277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0223  dihydropteroate synthase  35.34 
 
 
283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000034848  normal  0.0279297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  33.83 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
486 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  33.59 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9173  Dihydropteroate synthase  35.29 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  35.14 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  32.18 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  34.12 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0672  dihydropteroate synthase  28.72 
 
 
380 aa  126  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.999539  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1589  dihydropteroate synthase  33.57 
 
 
281 aa  127  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.864925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  34.12 
 
 
280 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  34.12 
 
 
280 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  34.12 
 
 
280 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  34.12 
 
 
280 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  33.73 
 
 
277 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  29.92 
 
 
273 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 
396 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  34.12 
 
 
280 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  30.53 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  34.01 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>