More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1814 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 289 aa  565  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  97.92 
 
 		 289 aa  528  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1766  dihydropteroate synthase  92.5 
 
 		 289 aa  470  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.202084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  77.54 
 
 		 278 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  75.18 
 
 		 295 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  77.12 
 
 		 279 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  52.87 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  53.97 
 
 		 257 aa  267  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  57.52 
 
 		 285 aa  261  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  56.3 
 
 		 285 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  48.51 
 
 		 280 aa  259  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 		 274 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  54.35 
 
 		 294 aa  258  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  48.51 
 
 		 277 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  48.13 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  48.13 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 		 280 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  50.77 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 		 277 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 		 277 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  47.39 
 
 		 286 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  46.74 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  47.76 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 394 aa  252  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  55.12 
 
 		 292 aa  251  7e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  47.89 
 
 		 269 aa  251  7e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  47.89 
 
 		 269 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 		 277 aa  248  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  55.91 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  52.11 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  47.69 
 
 		 407 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  54.72 
 
 		 392 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 279 aa  241  7e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  49.05 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 		 402 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1534  dihydropteroate synthase  50.75 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3533  dihydropteroate synthase  55.29 
 
 		 288 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139072  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  47.27 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  47.27 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  46.27 
 
 		 399 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1581  dihydropteroate synthase  49.45 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.239571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 		 289 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  54.4 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1412  dihydropteroate synthase  50.57 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3166  dihydropteroate synthase  49.47 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  54 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2115  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2183  dihydropteroate synthase  50.96 
 
 		 289 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0156937 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  48.86 
 
 		 396 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 397 aa  222  7e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  47.73 
 
 		 277 aa  221  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  49.03 
 
 		 279 aa  221  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 		 280 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  50.4 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  42.97 
 
 		 278 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  45.32 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  52.21 
 
 		 413 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 		 282 aa  211  9e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 		 282 aa  211  9e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  41.83 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  45.04 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  45.32 
 
 		 277 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  48.29 
 
 		 279 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  45.32 
 
 		 277 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  43.43 
 
 		 397 aa  209  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  41.54 
 
 		 281 aa  208  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 		 347 aa  208  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  46.33 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  45.77 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  46.3 
 
 		 290 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  46.72 
 
 		 280 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 		 286 aa  205  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 		 282 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 		 376 aa  204  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  45 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  45 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  47.23 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  51.91 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  44.62 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  41.64 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 		 279 aa  201  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 		 311 aa  201  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>