More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0145 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  49.48 
 
 		 277 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  46.92 
 
 		 277 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  48.61 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  49.08 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  49.45 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  48.72 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  49.45 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  49.45 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  49.45 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  48.35 
 
 		 282 aa  238  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 		 277 aa  238  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  49.09 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  45.82 
 
 		 278 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  47.25 
 
 		 277 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 394 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  45.09 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  45.55 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  47.79 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  44.9 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  43.38 
 
 		 275 aa  236  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  48.97 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  48.11 
 
 		 283 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 		 277 aa  235  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  43.26 
 
 		 400 aa  235  9e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  44.59 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  50.75 
 
 		 272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 		 278 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  49.64 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  48.96 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  47.22 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  39.73 
 
 		 283 aa  231  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  39.79 
 
 		 273 aa  229  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  47.92 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2317  dihydropteroate synthase  43.94 
 
 		 286 aa  228  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.052999  normal  0.0227117 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  43.11 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  46.69 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  47.58 
 
 		 277 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 		 397 aa  225  6e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  45.45 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  45.67 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  45.09 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  47.22 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  45.09 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  45.09 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  45.09 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  45.09 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  45.09 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  40.96 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  45.59 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0505  dihydropteroate synthase  39.47 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.183245  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  44.62 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  45.09 
 
 		 277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  42.39 
 
 		 288 aa  222  6e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  40.66 
 
 		 266 aa  222  6e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 283 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  44.73 
 
 		 286 aa  221  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  42.81 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0510  dihydropteroate synthase  43.29 
 
 		 293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 269 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  43.96 
 
 		 277 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  42.71 
 
 		 356 aa  219  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0420  dihydropteroate synthase  44.48 
 
 		 291 aa  219  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0615939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  45.93 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  47.84 
 
 		 277 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 277 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  42.18 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0499  dihydropteroate synthase  42.18 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.491755  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  42.41 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  41.58 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0223  dihydropteroate synthase  42.66 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000034848  normal  0.0279297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0982  dihydropteroate synthase  51.21 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5465  dihydropteroate synthase  40.64 
 
 		 286 aa  215  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  46.67 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  44.12 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  45.35 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  41.9 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  44.85 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  45.15 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  46.62 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  44.49 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 		 258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  44.49 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  41.31 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 280 aa  212  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  44.79 
 
 		 276 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>