More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2314 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2314  dihydropteroate synthase  100 
 
 
408 aa  828    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1815  dihydropteroate synthase  63.97 
 
 
410 aa  550  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0448294  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1468  dihydropteroate synthase  41.46 
 
 
418 aa  281  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.367897  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0021  dihydropteroate synthase  43.68 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2189  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 
270 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.292691  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1357  hypothetical protein  41.89 
 
 
267 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00595472  hitchhiker  0.0000000289975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0743  dihydropteroate synthase  39.53 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  39.78 
 
 
283 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1835  dihydropteroate synthase  39.68 
 
 
250 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  40.15 
 
 
283 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  40.58 
 
 
283 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  38.77 
 
 
283 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  40.43 
 
 
283 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  39.02 
 
 
266 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  40.51 
 
 
283 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  38.77 
 
 
283 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  40.68 
 
 
394 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  38.77 
 
 
283 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  39.69 
 
 
274 aa  169  6e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  36.6 
 
 
275 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  36.43 
 
 
270 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  37.77 
 
 
290 aa  166  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  37.55 
 
 
277 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  38.49 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0002  dihydropteroate synthase  35.42 
 
 
427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0616652  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  36.92 
 
 
287 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  36.57 
 
 
393 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  38.06 
 
 
276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  39.25 
 
 
277 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  37.41 
 
 
277 aa  163  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  39.25 
 
 
277 aa  162  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1387  dihydropteroate synthase  37.79 
 
 
405 aa  162  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.398618  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  37.89 
 
 
407 aa  162  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  37.04 
 
 
269 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  38.6 
 
 
277 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  37.8 
 
 
280 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  37 
 
 
279 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  37.04 
 
 
269 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  38.87 
 
 
277 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1844  dihydropteroate synthase  28.61 
 
 
397 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  38.31 
 
 
285 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  37.6 
 
 
402 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  38.87 
 
 
277 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  35.96 
 
 
286 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  39.54 
 
 
278 aa  159  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  37.4 
 
 
277 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  39.55 
 
 
290 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  37.25 
 
 
283 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  37.36 
 
 
277 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  37.01 
 
 
280 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  37.01 
 
 
280 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  37.01 
 
 
280 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  37.01 
 
 
280 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  37.01 
 
 
277 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  39.77 
 
 
287 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1313  dihydropteroate synthase  37.37 
 
 
300 aa  158  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0586375  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  39.05 
 
 
283 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  37.28 
 
 
311 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  36.82 
 
 
394 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  38.78 
 
 
397 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  38.27 
 
 
356 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  37.01 
 
 
277 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  37.55 
 
 
282 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  38.4 
 
 
278 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  36.61 
 
 
277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  36.98 
 
 
277 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  36.98 
 
 
277 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2317  dihydropteroate synthase  36.73 
 
 
286 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.052999  normal  0.0227117 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  38.81 
 
 
277 aa  156  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  38.93 
 
 
294 aa  156  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1505  dihydropteroate synthase  37.69 
 
 
289 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  39.42 
 
 
283 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1439  dihydropteroate synthase  37.69 
 
 
297 aa  155  9e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  37.83 
 
 
277 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  35.51 
 
 
281 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  36.33 
 
 
282 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  38.01 
 
 
277 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 
286 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  37.18 
 
 
282 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  37.18 
 
 
282 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  37.18 
 
 
282 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  37.18 
 
 
282 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  36.98 
 
 
376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  37.18 
 
 
282 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  38.58 
 
 
284 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  38.01 
 
 
277 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  37.18 
 
 
282 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  37.18 
 
 
282 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  37.18 
 
 
282 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  36.82 
 
 
282 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  37.92 
 
 
278 aa  152  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  36.26 
 
 
286 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  35.91 
 
 
274 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  35.8 
 
 
282 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 
277 aa  151  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  38.64 
 
 
277 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  38.26 
 
 
277 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  35.98 
 
 
280 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  37.64 
 
 
274 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0505  dihydropteroate synthase  35.51 
 
 
303 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.183245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>