More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1098 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  100 
 
 
269 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  99.26 
 
 
269 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  59.18 
 
 
285 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  56.88 
 
 
274 aa  319  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  60.59 
 
 
274 aa  318  5e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  58.62 
 
 
283 aa  315  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  56.98 
 
 
270 aa  309  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  55.43 
 
 
277 aa  308  5e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  56.72 
 
 
393 aa  308  5e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  56.93 
 
 
286 aa  306  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  56.93 
 
 
277 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  56.55 
 
 
280 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  56.55 
 
 
280 aa  305  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  56.55 
 
 
280 aa  305  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  56.55 
 
 
280 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  56.55 
 
 
277 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  56.55 
 
 
280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  56.55 
 
 
277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  56.18 
 
 
277 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  56.54 
 
 
394 aa  298  5e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  54.23 
 
 
402 aa  291  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  54.14 
 
 
394 aa  288  7e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  52.06 
 
 
407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  52.47 
 
 
399 aa  285  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  53.79 
 
 
396 aa  278  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  51.13 
 
 
284 aa  271  7e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  51.13 
 
 
282 aa  268  7e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 
282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  54.96 
 
 
376 aa  256  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  47.71 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  45.83 
 
 
295 aa  250  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 
400 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  47.78 
 
 
278 aa  248  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  45.62 
 
 
287 aa  248  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  47.78 
 
 
278 aa  247  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  47.89 
 
 
289 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  46.01 
 
 
397 aa  246  3e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  46.01 
 
 
279 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  48.74 
 
 
279 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  48.74 
 
 
279 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  49.41 
 
 
400 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  47.51 
 
 
289 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 
283 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  45.77 
 
 
283 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 
280 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  43.42 
 
 
412 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  46.13 
 
 
347 aa  234  8e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  44.79 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  46.79 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  47.79 
 
 
286 aa  233  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  46.96 
 
 
277 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  48.08 
 
 
266 aa  233  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  47.41 
 
 
267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  45.05 
 
 
290 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 
277 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 
277 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  46.92 
 
 
275 aa  231  9e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
285 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3166  dihydropteroate synthase  42.27 
 
 
418 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 
277 aa  229  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1766  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 
289 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.202084  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  46.01 
 
 
279 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1534  dihydropteroate synthase  43.46 
 
 
289 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  45.17 
 
 
277 aa  229  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  46.31 
 
 
274 aa  229  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  45.7 
 
 
282 aa  228  6e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  46.12 
 
 
283 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  47.18 
 
 
280 aa  227  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
279 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  43.01 
 
 
286 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  45.75 
 
 
277 aa  225  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0536  dihydropteroate synthase  49.2 
 
 
267 aa  224  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0712347  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0549  dihydropteroate synthase  49.2 
 
 
267 aa  224  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 
278 aa  224  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
279 aa  224  9e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  45 
 
 
257 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  43.63 
 
 
280 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  46.96 
 
 
284 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  47.47 
 
 
278 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0153  dihydropteroate synthase  47.69 
 
 
272 aa  223  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.77759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 
279 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  44.13 
 
 
277 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  44.62 
 
 
311 aa  222  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 
277 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 
277 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 
277 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  46.75 
 
 
259 aa  221  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  45.08 
 
 
275 aa  221  8e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  43.13 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  43.46 
 
 
277 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  43.46 
 
 
277 aa  219  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  43.42 
 
 
291 aa  218  7e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  40.66 
 
 
283 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  41.94 
 
 
277 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  43.78 
 
 
277 aa  217  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 
294 aa  216  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>